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生物Python分子工具

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

Biopython 是一套完整的 Python 分子生物工具，支持序列操作、文件格式转换、NCBI 接入、BLAST 自动化、结构解析与系统发育分析，适合构建生物信息流程与批量任务。

分子动力学模拟工具包

molecular-dynamics

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

基于 OpenMM 与 MDAnalysis，准备系统、能量最小化与平衡模拟，分析蛋白质构象、药物结合与自由能等轨迹特性。

系统发育分析流程

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

使用MAFFT、IQ-TREE 2、FastTree等工具完成对齐、进化树构建与可视化，适用于微生物、病毒、蛋白家族等的系统发育与分子钟分析。

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