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Arboreto基因调控网络
arboreto
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
139
Arboreto利用GRNBoost2/GENIE3从批量或单细胞RNA-seq表达数据中推理转录因子与靶基因调控关系,支持TF筛选与Dask分布式运行,输出排序链接供后续分析。
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用Arboreto推断基因调控网络
arboreto
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
419
Arboreto是一个强大的Python库,用于从各种基因表达数据集(包括bulk和scRNA-seq)推断基因调控网络(GRNs)。它利用GRNBoost2和GENIE3等高级机器学习算法,支持Dask的分布式计算,适用于分析大规模的转录组学数据。它可以帮助用户识别关键的转录因子-靶基因调控关系。
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