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PyDESeq2 差异表达分析
pydeseq2
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
63
PyDESeq2 将 DESeq2 差异表达流程搬到 Python 中,可加载批量 RNA-seq 计数、设定设计公式、拟合模型、执行 Wald 检验并做 FDR 校正,支持 apeGLM 收缩及与 pandas/AnnData 流程衔接,便于导出基因级统计结果。
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单细胞生成建模工具集
scvi-tools
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
353
基于 PyTorch 的单细胞组学概率生成模型框架,统一 API 支持批次校正、数据整合、多模态/空间分析、差异表达与迁移学习,适合高级建模流程。
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PyDESeq2 差异表达分析
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K-Dense-AI/scientific-agent-skills
296
PyDESeq2 将 DESeq2 差异表达流程搬到 Python 中,可加载批量 RNA-seq 计数、设定设计公式、拟合模型、执行 Wald 检验并做 FDR 校正,支持 apeGLM 收缩及与 pandas/AnnData 流程衔接,便于导出基因级统计结果。
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单细胞生成建模工具集
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K-Dense-AI/scientific-agent-skills
383
基于 PyTorch 的单细胞组学概率生成模型框架,统一 API 支持批次校正、数据整合、多模态/空间分析、差异表达与迁移学习,适合高级建模流程。
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