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细胞图谱数据查询与分析

cellxgene-census
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
225
该技能提供对CZ CELLxGENE大型公共单细胞和空间转录组学数据的程序化访问。用户无需下载整个数据集，即可按细胞类型、组织、疾病等维度进行高效查询，获取基因表达矩阵、元数据和预计算的嵌入信息。适用于大规模、跨数据集的生物学研究和模型训练。
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学术文献引用与管理

citation-management
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
103
该技能提供全面的学术引用管理解决方案，用于科学研究和撰写学术论文。用户可以通过它在Google Scholar和PubMed等数据库搜索文献，提取准确的元数据，验证引文信息，并生成标准的BibTeX格式。同时支持生成科学示意图，提高文档的可视化和专业性。
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临床决策支持报告生成

clinical-decision-support
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
102
为制药和临床研究领域生成专业的临床决策支持（CDS）文档。该技能专注于基于证据的分析，包括生物标志物分层患者队列分析、带GRADE分级的治疗推荐报告。支持高级统计分析和专业格式输出，适用于监管申报和医学指南的撰写。
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临床报告撰写与规范化

clinical-reports
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
320
本技能旨在提供专业、全面的医疗报告撰写支持，覆盖病例报告、诊断报告、临床试验报告和病历记录等。它严格要求遵循HIPAA、FDA和ICH-GCP等监管标准，并强制利用AI生成科学图表，确保文档具备高度的准确性、完整性和可发布性。
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癌症依赖图谱查询分析

depmap
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
475
利用该技能查询癌症依赖图谱（DepMap）数据，系统分析不同癌症细胞系对基因的依赖性。该工具可用于生物信息学研究，帮助研究人员识别特定癌症类型的关键致病基因、发现合成致死相互作用，并为肿瘤药物靶点验证提供科学依据。
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ESM蛋白质语言模型与设计

esm
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
342
该技能基于ESM（进化尺度模型）系列，为蛋白质组学和计算生物学提供全流程解决方案。核心功能包括：利用ESM3进行蛋白质序列生成（从头设计）、结构预测（序列到3D结构）和逆向折叠（结构到序列设计）。同时，可以使用ESMC模型提取高质量蛋白质嵌入，支持功能注释和高级生物信息学研究。
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检测可用计算资源

get-available-resources
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
465
该技能用于主动检测和报告全面的系统资源，包括CPU核心、GPU类型（NVIDIA、AMD、Apple Silicon）、可用内存和磁盘空间。它生成一个详细的JSON报告，并提供基于上下文的策略性建议，指导用户优化科学计算流程。例如，它会推荐并行处理库（Dask, joblib）、内存外存储方法（Zarr）或合适的GPU加速后端，帮助用户在进行大规模数据分析或模型训练前做出架构决策。
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蛋白质糖基化分析与工程设计

glycoengineering
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
121
本技能提供全面的工具用于分析和工程化蛋白质的糖基化修饰。它可以扫描氨基酸序列识别N-糖基化位点（N-X-S/T）并预测O-糖基化热点。主要应用于优化治疗性抗体、设计疫苗抗原和分析生物类似物，从而改善蛋白质的稳定性、功能或免疫逃逸能力。
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AI专业信息图表生成

infographics
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
95
本技能利用AI技术（Nano Banana Pro）生成专业、高质量的信息图表。它集成了网络研究功能，自动抓取准确的数据和统计信息，支持时间线、对比图、统计图等多种可视化类型。系统内置智能迭代和质量审核机制，确保输出符合不同文档类型的专业标准，无需任何设计经验即可快速生成。
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LabArchives电子实验记录本API集成

labarchive-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
165
本技能提供全面的LabArchives电子实验记录本（ELN）API集成，支持程序化管理实验记录本。功能包括自动化创建/修改条目、上传各类附件、执行完整备份、生成使用报告，并可与Protocols.io、Jupyter等第三方工具无缝集成，适用于科研流程自动化。
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AI 代理技能管理

manage-skills
rohitg00/awesome-claude-code-toolkit
498
通过命令行统一管理 Cursor、Claude 等 11 个工具的技能与规则，支持创建、复制、移动、启用/禁用、搜索、跨工具转换以及全局与项目作用域覆盖操作。
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Markdown与Mermaid图表文档编写

markdown-mermaid-writing
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
96
本技能指导用户使用Markdown和嵌入式Mermaid图表来编写科学和技术文档。它强制将流程图、架构图等以纯文本形式记录，确保图表在Git中可进行干净的差异对比（diff），并能在GitHub、Notion等主流平台上原生渲染，极大地提升了文档的可维护性和协作性。
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