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COSMIC癌症突变数据访问

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K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过认证获取COSMIC癌症突变数据，包括编码突变、基因普查、突变特征、融合、拷贝数、表达与耐药突变，支撑生信分析与精准肿瘤研究。

cBioPortal癌症基因组数据

cbioportal-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 cBioPortal REST API 查询 TCGA、GENIE 等肿瘤研究的突变、拷贝数、表达和生存数据，可用于癌基因验证、共突变模式分析与临床变量关联研究。

癌症依赖图谱分析工具

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该工具提供癌症依赖图谱（DepMap）数据接口，基于全基因组CRISPR筛选、RNAi和化合物敏感性实验。可用于查询基因的依赖性评分，识别特定于癌症的脆弱点，预测合成致死作用，并验证肿瘤学药物靶点。

pacsomatic配对肿瘤-正常分析工作流

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本技能提供了一个用于配对肿瘤-正常样本分析的完整、可复现工作流。它负责处理输入验证（如BAM文件、样本ID），生成符合pacsomatic规范的样本表和启动脚本，并支持本地运行或提交到集群调度器（如Slurm）。适用于启动、验证或排查整个生物信息学分析流程。

肿瘤学期刊投稿匹配度评估

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brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills

本技能为作者评估其临床或转化肿瘤学研究是否适合投递《Annals of Oncology》。它详细涵盖了期刊对于高质量、具有临床转化意义研究的严格要求，包括随机对照试验设计、生物标志物验证、遵循特定报告规范（如CONSORT/STROBE）和与ESMO指南的匹配度。这是一个辅助判断投稿适用性的工具，不能替代专业的医疗或监管建议。

癌症期刊投稿匹配度评估

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本技能旨在帮助作者评估其肿瘤学稿件是否适合顶级临床期刊（如CA）。它详细指导了目标期刊的编辑偏好、适用范围（如流行病学分析、证据综合）、证据标准和写作风格。用于投稿前，帮助作者重构和优化稿件，确保其符合权威医学出版的高标准。

癌症发现投稿指南

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该技能为目标投递至《癌症发现》等高影响力肿瘤学期刊的作者提供综合指南。它详细阐述了期刊特有的文章适用性、要求的证据标准、结构规范和潜在的拒稿风险，适用于选择投稿期刊、优化手稿框架或准备投稿。

癌症细胞期刊投稿范围评估

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本指南用于评估分子或转化肿瘤学研究是否达到顶级期刊《Cancer Cell》的发表标准。它帮助研究人员系统性地判断研究是否具备足够的机制深度和临床转化相关性，从而在投入大量精力撰写稿件前，优化研究设计和定位。

JAMA肿瘤学期刊投稿指南

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本技能为作者提交临床、转化或流行病学的肿瘤学研究，并将其投递至JAMA Oncology提供了全面的投稿指南。它涵盖了期刊匹配度评估、所需的方法学严谨性（如随机对照试验、真实世界证据、生物标志物验证），以及必须遵循的报告指南和投稿要求。它是评估研究是否具有临床决策相关性和证据基础的关键工具。

临床肿瘤学杂志投稿标准指南

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本技能是为目标投稿至《临床肿瘤学杂志》（JCO）的作者提供的全方位指南。它详细阐述了该期刊对稿件的极高学术标准，涵盖了研究设计（如III期随机对照试验）、证据深度要求、数据报告规范、以及最新的投稿格式要求，旨在帮助作者优化论文，提升被顶级肿瘤学期刊接受的几率。

国际肿瘤综述期刊投稿指南

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本指南帮助作者判断其权威的临床肿瘤学综述或观点是否适合《Nature Reviews Clinical Oncology》。详细介绍了要求的综述深度、适用范围、投稿模式（如邀请或提议），并强调该期刊不接受原始研究数据，确保稿件符合权威综述的标准。

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