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Datamol化学信息工具

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

Datamol 提供 rdkit 的 Python 化封装，简化 SMILES/SELFIES/InChI 解析、结构标准化、分子描述符/指纹、聚类、3D 构象、并行批处理及云存储读写等药物发现流程，并保持与 rdkit.Chem.Mol 对象的兼容性。

DrugBank 数据洞察

drugbank-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

提供 DrugBank 的药物与靶点数据访问，涵盖数据下载、信息查询、药物相互作用网络、靶点与通路分析以及化学相似性比较，支持药理研究与临床安全评估。

医药化学筛选工具

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

Medchem 是面向药物发现的 Python 库，提供药性规则、结构警报、官能团检测、标准目录、复杂度评估与自定义约束，帮助批量筛选化合物库并优先挑选候选分子。

PubChem 化学数据库查询

pubchem-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 PUG-REST API 或 PubChemPy 查询 PubChem 百万化合物库，按名称、CID 或结构检索性质、相似性/子结构、活性数据，并支持格式互转，适用于化学信息分析与药物筛选。

高级分子控制

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

RDKit 是 Python 化学信息学库，支持读取/写入分子、描述符计算、指纹、子结构搜索、反应变换与 2D/3D 可视化，适合药物发现与计算化学研究。

Datamol化学信息工具

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

Datamol 提供 rdkit 的 Python 化封装，简化 SMILES/SELFIES/InChI 解析、结构标准化、分子描述符/指纹、聚类、3D 构象、并行批处理及云存储读写等药物发现流程，并保持与 rdkit.Chem.Mol 对象的兼容性。

医药化学筛选工具

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

Medchem 是面向药物发现的 Python 库，提供药性规则、结构警报、官能团检测、标准目录、复杂度评估与自定义约束，帮助批量筛选化合物库并优先挑选候选分子。

分子建模化学信息学工具包

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RDKit是一个功能全面的化学信息学库，提供强大的Python API，用于分子分析和操控。它支持读取和写入多种分子格式（如SMILES, SDF, InChI），计算理化描述符（分子量、LogP、TPSA），执行子结构搜索和立体化学分析。该工具对于药物发现、计算化学和高级化学信息学研究工作流程至关重要。

云端分子建模与药物设计

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Rowan是一个云原生的分子模拟和药物设计工作流平台，通过Python API提供服务。用户无需维护本地HPC或GPU资源，即可在云端进行pKa预测、分子对接、构象搜索、蛋白质-配体共折叠等复杂计算。它特别适用于需要大规模批量筛选和多步骤流程的药物化学研究。

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