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ChEMBL 生物活性查询
chembl-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
260
通过 ChEMBL Python 客户端访问化合物、靶点、活性与药物数据,按结构/性质/活性过滤,支撑抑制剂发现与 SAR 分析。
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Datamol化学信息工具
datamol
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
169
Datamol 提供 rdkit 的 Python 化封装,简化 SMILES/SELFIES/InChI 解析、结构标准化、分子描述符/指纹、聚类、3D 构象、并行批处理及云存储读写等药物发现流程,并保持与 rdkit.Chem.Mol 对象的兼容性。
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医药化学筛选工具
medchem
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
219
Medchem 是面向药物发现的 Python 库,提供药性规则、结构警报、官能团检测、标准目录、复杂度评估与自定义约束,帮助批量筛选化合物库并优先挑选候选分子。
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开放靶点数据库平台
opentargets-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
293
通过 Open Targets GraphQL API 查询靶点-疾病关联、可成药性、安全性、药物及多组学证据,帮助完成治疗靶点发现、优先级排序、安全评估和药物再利用等工作。
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PDB结构浏览器
pdb-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
130
通过 RCSB PDB 搜索蛋白或核酸结构、下载 PDB/mmCIF/Binary 坐标文件、获取实验元数据并批量处理,为药物发现、蛋白工程和结构生物学提供数据支撑。
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治疗数据共享平台
pytdc
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
402
提供面向治疗学的 AI 准备药物发现数据集(ADME、毒性、DTI、DDI、分子生成),包含标准化评估、scaffold 拆分与分子预测器,帮助科研人员训练、对比、优化疗法 ML 模型。
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高级分子控制
rdkit
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
327
RDKit 是 Python 化学信息学库,支持读取/写入分子、描述符计算、指纹、子结构搜索、反应变换与 2D/3D 可视化,适合药物发现与计算化学研究。
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BindingDB 亲和力查询
bindingdb-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
257
通过 BindingDB 的 REST 接口或下载表格获取药物-靶标的 Ki/Kd/IC50/EC50 亲和力数据,辅助靶点驱动的药物发现、SAR 分析、先导化合物评估和基准数据集构建。
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DepMap 依赖数据探索
depmap
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
125
通过 DepMap 查询癌细胞系的 CRISPR Chronos 依赖评分、药物敏感性与基因效应,辅助靶点验证、生物标志物发现与合成致死研究,可用 API 或批量下载进行分析。
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PrimeKG精准医学图谱查询
primekg
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
188
通过程序化脚本查询PrimeKG精准医学知识图谱的基因、药物、疾病与表型等实体及其关系,辅助药物发现、可复用性验证与表型网络分析。
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1
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简体中文
English