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Pysam基因组分析工具
pysam
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
250
Pysam 提供 htslib 的 Python 接口,可读写 SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FASTQ,便于提取区域、计算覆盖、分析变异,并支持 NGS 流水线集成。
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TileDB VCF 变体存储
tiledbvcf
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
466
TileDB-VCF 使用 TileDB 稀疏数组高效管理 VCF/BCF 变异数据,支持增量样本、并行区域查询、云本地存储与导出,适合群体基因组分析与变异数据库构建。
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Pysam基因组分析工具
pysam
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
369
Pysam 提供 htslib 的 Python 接口,可读写 SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FASTQ,便于提取区域、计算覆盖、分析变异,并支持 NGS 流水线集成。
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基因组变异数据存储与查询
tiledbvcf
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
309
TileDB-VCF是一个高性能的基因组变异数据管理工具,基于TileDB技术。它支持VCF/BCF数据的可扩展、增量式存储和高效查询。用户可以构建大型群体基因组数据库,进行全基因组关联研究(GWAS)或进行大规模的群体变异分析。
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