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分子动力学工具

molecular-dynamics

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

利用 OpenMM 与 MDAnalysis 建立蛋白或小分子体系，执行能量最小化、均衡和轨迹分析（RMSD、RMSF、接触图与自由能面），为结构生物学与药物结合研究提供数据支撑。

分子动力学模拟流程

molecular-dynamics

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

本技能提供分子动力学模拟的完整工作流程，涵盖了系统构建、势场定义、能量最小化和平衡化过程。使用OpenMM和MDAnalysis等专业工具，适用于蛋白质结构稳定性分析、药物结合建模及生物物理学研究。

MDA源文件参考与示例

这是一个极简的示例文件，用于演示MDA源文件的结构。它展示了如何在顶部使用高级元数据字段（metadata），以及如何正确地为关系图脚注（relationship-graph footnotes）进行标记。它可作为学习MDA源格式的重要参考模板。

MDA兼容性演示（Codex CLI）

mda-compat-codex-cli

此技术技能用于验证Codex CLI与由MDA源文件编译的技能的兼容性。加载此技能确认了CLI加载器能够成功解析SKILL.md格式，并遵循agentskills.io v1标准。它主要用于测试构建流程、元数据完整性，确保MDA编译与运行时摄取之间的鲁棒兼容性。

MDA兼容性演示（Hermes代理）

mda-compat-hermes

本技能是一个兼容性演示工具，用于验证Hermes Agent是否能够成功解析和加载由MDA源文件编译生成的SKILL.md。它确认了从MDA到SKILL.md的编译过程的结构完整性，确保了元数据和目录结构符合代理的要求。

MDA兼容性演示（Claude Code）

mda-compat-intro

此演示技能用于验证基于MDA编译的SKILL.md文件在Claude Code环境中的兼容性。它确认了技能的前置元数据、结构和允许工具是否能被加载器正确解析和识别，确保了编译内容的平稳集成，主要用于开发验证目的。

MDA兼容性演示（OpenClaw）

mda-compat-openclaw

此技能用于演示和验证OpenClaw平台对通过MDA编译的技能的兼容性。它确认了MDA源文件能成功安装并被OpenClaw正确解析和识别，用于验证技能格式和加载流程的稳定性。

OpenCode MDA兼容性演示

mda-compat-opencode

本技能旨在演示和验证OpenCode对通过MDA编译的SKILL.md文件的兼容性。它确保加载器能够正确解析核心的元数据字段（如名称、描述和元数据），保证了技能集成流程的健壮性与数据完整性。

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