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搜索 NCBI ，共找到 12 条记录

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ClinVar 变异临床意义查询

clinvar-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

查询ClinVar数据库以获取变异临床意义，通过网页/API访问、FTP批量下载并注释VCF，辅助基因组医学解读。

系统发育树工具包

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一个用于系统发育树分析的套件，支持树结构操作、进化事件检测、NCBI分类学集成以及 PDF/SVG 等可视化，适合系统发育组学与基因家族研究。

NCBI基因查询助手

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 E-utilities 或 Datasets API 查询 NCBI Gene，按符号或 ID 获取 RefSeq、GO、定位、表型等信息，支持批量检索与注释分析。

GEO基因表达提取器

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

连接NCBI GEO仓库，通过Entrez搜索GSE/GSM/GPL/Profiles，获取基因表达数据、实验设计和矩阵文件，配合GEOparse下载分析所需的转录组资料。

PubMed 数据库访问

pubmed-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 PubMed 的 REST/API 接口构建布尔、MeSH 查询，按类型和时间等属性过滤文献，并借助 NCBI E-utilities 自动抓取摘要、引用和批量处理。

Biopython 生物信息学工作流

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提供 Biopython 工作流，用于序列操作、FASTA/GenBank/PDB 文件解析、系统发育分析、BLAST 自动化、结构分析，以及通过 Bio.Entrez 访问 NCBI/PubMed。

ETE 4 系统发育树分析工具

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分析、操作、比较和可视化系统发育树或层次树。支持Newick/Nexus输入输出、拓扑编辑、Robinson-Foulds比较、基因树进化事件分析、NCBI/GTDB分类学查询和出版渲染。适用于对齐和推断后已有的树，不用于从原始序列推断。

生物医学文献检索与分析

pubmed-database

affaan-m/everything-claude-code

本指南提供了一个系统性的生物医学文献检索和数据提取工作流。内容涵盖了使用MeSH词汇和高级字段标签构建复杂的PubMed查询，设置日期和文献类型过滤器，并提供了基于NCBI E-utilities的Python API工作流。适用于进行系统综述、文献挖掘和科研数据监控。

生物医学文献检索与分析

pubmed-database

本指南提供了一个系统性的生物医学文献检索和数据提取工作流。内容涵盖了使用MeSH词汇和高级字段标签构建复杂的PubMed查询，设置日期和文献类型过滤器，并提供了基于NCBI E-utilities的Python API工作流。适用于进行系统综述、文献挖掘和科研数据监控。

Biopython：生物计算工具箱

sickn33/antigravity-awesome-skills

Biopython是一个全面的Python库，专为计算分子生物学而设计。它提供了处理生物序列（DNA、RNA、蛋白质）、结构分析（PDB）、序列比对、系统发育树构建以及与NCBI等主要公共数据库交互的强大功能。适用于进行高级生物信息学分析的研究人员。

检索PubMed/PMC生物医学文献

mining-pubmed-literature

maziyarpanahi/openmed

该技能利用NCBI E-utilities（如ESearch/EFetch）程序化地检索和获取PubMed及PMC的生物医学文献。它可以汇集特定疾病、药物或基因相关的文献摘要、全文和元数据，常用于构建证据库、进行生物医学命名实体识别或总结科学发现。

PubMed 生物医学文献检索

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通过 NCBI E-utilities 直接检索 PubMed 生物医学文献，构建 MeSH 查询与字段标签，按出版类型和日期过滤，获取 PMID、摘要与引用，适用于系统综述检索路径和文献监测。

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