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药化过滤工具集

medchem
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65
Medchem 是一个 Python 库，用于执行药物可行性规则、结构告警、复杂度评估和自定义约束，对化合物库进行并行筛选，辅助先导化合物优化与质量审查。
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Modal 无服务器 GPU 平台

modal
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294
Modal 提供面向 Python 的无服务器云，可在 GPU 上部署 AI/ML、持久存储、调度任务和 web 接口，无需运维。
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分子特征化中心

molfeat
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100
Molfeat 提供 100 多种分子特征器与预训练嵌入，可将 SMILES 或 RDKit 分子转换为适合 QSAR、虚拟筛选、相似性搜索与深度学习的数值特征，支持并行、缓存与 scikit-learn 集成。
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网络分析工具包

networkx
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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为社交、生物、交通等系统提供 Python 图网络构建、算法分析、生成、导入导出与可视化能力，方便探索实体关系与结构特征。
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生理信号处理工具

neurokit2
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479
NeuroKit2 是面向 ECG、EEG、EDA、RSP、PPG、EMG、EOG 等多种生理信号的 Python 工具包，可用于心率变异、事件相关电位、复杂性、交感副交感评估及多模态融合研究。
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OMERO 显微图像管理

omero-integration
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272
本技能通过 Python 接口连接 OMERO 服务器，遍历项目与图像、提取像素与 ROI、添加注释标签并运行批量分析，适用于高通量显微成像管理与计算流程。
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病理切片分析工具

pathml
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PathML 是面向计算型病理的 Python 工具，支持整张切片读取、染色预处理、空间图谱构建以及多参数免疫荧光数据的机器学习分析。
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Plotly 交互式图表

plotly
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Plotly 是 Python 交互式图形库，适合数据探索、仪表盘与汇报，支持提示、缩放、动画和多种导出格式。
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Polars 数据框架

polars
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基于 Arrow 的高性能 Python/Rust 数据框架，利用懒执行和并行计算驱动 1-100GB 的 ETL 管道，可作为更快的 pandas 替代方案。
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PyDESeq2 差异表达分析

pydeseq2
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PyDESeq2 是在 Python 中复现 DESeq2 的差异表达分析工具，可载入 bulk RNA-seq 计数、过滤低表达基因、指定单/多因素设计、执行 Wald 检验并进行 LFC 收缩，方便结合 pandas/AnnData 管道输出结果和可视化。
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Pydicom 医学影像处理

pydicom
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Pydicom 提供 Python 接口，读取/写入 DICOM 医学影像、提取像素、修改元数据、匿名化、转换格式及处理压缩文件，适用于放射科影像分析与 PACS 集成等场景。
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PyHealth 医疗 AI 工具包

pyhealth
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PyHealth 提供面向电子病历、信号、影像与编码数据的临床预测模型开发、训练、评估与部署能力，包含标准化数据集、任务、模型与解释、校准等模块，适合医疗 AI 场景。
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