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UniProt
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AlphaFold结构访问
alphafold-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
470
通过 UniProt 编号获取 AlphaFold 预测的蛋白质结构,下载 mmCIF/PDB 文件,分析 pLDDT/PAE 置信度,并用于结构分析或药物研发流程。
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UniProt数据库接口
uniprot-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
275
通过 UniProt REST API 搜索蛋白质、获取 FASTA 与注释、执行 ID 映射并流式下载,适合 Python 工作流和批量分析。
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UniProt蛋白质数据库查询与分析
uniprot-database
sickn33/antigravity-awesome-skills
185
用于访问和查询UniProt蛋白质数据库,这是蛋白质序列和功能信息领域的权威资源。支持通过名称、基因或访问号搜索蛋白质,检索FASTA格式序列,实现跨数据库ID映射(如Ensembl, RefSeq),并分析GO术语等功能注释,是生物信息学数据分析的核心工具。
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生物信息服务Python接口
bioservices
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
385
通过 Python 访问 UniProt、KEGG、ChEMBL、Reactome、QuickGO、UniChem 等生物信息服务的客户端,支持跨库蛋白质注释、通路检索、化合物标识映射与整合分析。
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基因组快速生物信息学搜索工具
gget
affaan-m/ECC
468
gget是一个强大的命令行和Python工具包,用于快速、可重复地在主要的基因组参考数据库(如Ensembl、UniProt)中进行生物信息学搜索。它能让用户快速查询基因元数据、执行初步的BLAST/BLAT比对,并探索相关通路、癌症或疾病模块。该工具尤其适用于初始的数据探索和生成可重复的证据记录,而不是复杂的生产级流程。
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UniProt 蛋白质数据库 API
uniprot-database
sickn33/agentic-awesome-skills
181
通过 REST API 访问 UniProt 蛋白质数据库,支持按基因、登录号或物种检索蛋白条目、获取 FASTA 序列、在 Ensembl/RefSeq/PDB 等数据库间映射标识符、自定义返回字段并流式下载大规模数据集。
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蛋白质结构预测数据库
alphafold-database
davila7/claude-code-templates
394
通过 UniProt ID 或 API 访问 AlphaFold 超过 2 亿个 AI 预测蛋白质结构,下载 PDB/mmCIF 文件,并分析 pLDDT/PAE 置信度指标,适用于结构生物学与药物发现。
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