下载

Skill UI

浏览并发现 10667+ 精选技能

全部编程开发人工智能设计创意产品商业数据科学市场营销职场通用效率工具硬件工程语言学习

搜索 VCF ，共找到 9 条记录

默认排序最新上传最多下载

ClinVar 变异临床意义查询

clinvar-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

查询ClinVar数据库以获取变异临床意义，通过网页/API访问、FTP批量下载并注释VCF，辅助基因组医学解读。

DNAnexus 云基因组集成

dnanexus-integration

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 DNAnexus 云基因组平台开发 app/applet、管理 FASTQ/BAM/VCF 等数据、运行工作流，并使用 dxpy 自动化脚本，支撑生物医学流水线。

Pysam基因组分析工具

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

Pysam 提供 htslib 的 Python 接口，可读写 SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FASTQ，便于提取区域、计算覆盖、分析变异，并支持 NGS 流水线集成。

TileDB VCF 变体存储

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

TileDB-VCF 使用 TileDB 稀疏数组高效管理 VCF/BCF 变异数据，支持增量样本、并行区域查询、云本地存储与导出，适合群体基因组分析与变异数据库构建。

Polars Bio基因组工具

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

polars-bio 依托 Polars、Arrow 与 DataFusion，提供高性能基因组区间运算、BED/VCF/BAM/CRAM/GFF/FASTA 等生信文件读写、SQL 查询及流式处理，适合云存储与大文件场景，可替代 bioframe。

DNAnexus基因组学云平台集成

dnanexus-integration

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

这是一个用于在DNAnexus云平台上开发和执行基因组学分析流程的综合工具包。它覆盖了从应用构建、管理大型生物医学数据集（如FASTQ, BAM, VCF）到工作流编排和使用dxpy Python SDK进行程序化交互的全生命周期。

基因组数据操作与分析

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

这是一个基于Polars的高性能基因组数据处理库。它支持核心区间运算（如重叠、合并、互补）以及主流生物信息学文件格式（如VCF、BAM、BED、GFF）的读写。特别适用于处理超大型、无法一次性加载到内存的基因组数据集，支持流式和云端存储I/O。

基因组数据处理与分析

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

Pysam是一个专业的基因组数据处理Python模块。它提供了一个Python接口，用于读写和操作主流基因组格式，包括BAM/CRAM比对文件、VCF/BCF变异文件和FASTA/FASTQ序列。广泛应用于基因组测序分析、变异检测、覆盖度计算以及构建复杂的生物信息学流程。

TileDB基因变异数据管理器

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

TileDB-VCF是一款高性能的基因组变异数据管理工具，基于TileDB技术。它能够高效、可扩展地存储和检索基因组变异数据（VCF/BCF），支持增量式样本添加、跨区域和样本的并行查询，是进行群体基因组学和队列研究的理想选择。

1

语言