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金盏花云实验室:自动化生物研究
ginkgo-cloud-lab
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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金盏花云实验室提供远程接入先进的自主生物研究平台。用户可以在此提交和管理复杂的实验协议,主要包括无细胞蛋白表达(验证与优化)和荧光生物艺术生成。平台集成了机器人自动化系统和AI智能体EstiMate,能够为定制化流程提供可行性评估和报价,适用于高通量生物研究。
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生物数据管理与分析平台
lamindb
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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LaminDB是一个专为生物学复杂数据集设计的开源数据框架。它提供了统一的湖仓架构,确保数据可查询、可追溯、可复现和符合FAIR原则。适用于管理多模态基因组数据(如scRNA-seq、空间转录组学),追踪计算流程,利用生物本体进行数据策展,并集成机器学习工作流。
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生物信息学工作流平台
latchbio-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Latch是一个强大的Python框架,专为构建和部署可扩展的无服务器生物信息学工作流而设计。它允许用户使用Python装饰器定义复杂工作流,无缝集成Nextflow和Snakemake等主流工具,并通过LatchFile/LatchDir管理云数据。平台提供高级资源配置、GPU支持以及用于RNA-seq和AlphaFold等任务的预验证流程,确保计算生物学实验的高可重复性和效率。
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无服务器AI/ML云平台
modal
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Modal是一个无服务器云平台,专为AI/ML工作负载设计,允许用户直接用Python代码运行复杂的计算任务。它提供按需的GPU算力、自动扩缩容的函数调用、自定义容器构建和持久化存储。适用于模型部署、训练推理、构建高性能API和定时任务。
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综合生物信号处理工具箱
neurokit2
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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本工具箱是一个全面的生理信号分析平台,可处理心电图(ECG)、脑电图(EEG)、皮肤电导(EDA)等多类型生物信号。它支持心率变异性分析、脑状态识别、自主神经系统评估等高级分析,广泛应用于心理生理学和临床研究。
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OMERO显微镜图像数据分析平台
omero-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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本技能为OMERO(开源显微镜数据管理平台)提供了全面的Python集成,用于管理、可视化和分析复杂的显微图像数据。支持通过代码访问图像、检索数据集、管理感兴趣区域(ROIs)和注释,执行深层像素分析,并为高通量筛选和生物成像工作流进行批处理。
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PyTDC:药物发现机器学习数据集
pytdc
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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PyTDC是一个开放科学平台,专门为药物发现和治疗领域提供标准化、可直接用于AI训练的权威数据集和基准。它支持单实例预测(如ADME、毒性)、多实例预测(药物-靶点相互作用DTI)以及分子生成等多种核心任务,是药物机器学习模型开发和性能评估的必备工具。
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Qiskit量子计算框架
qiskit
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Qiskit是一个领先的开源量子计算框架,允许用户构建、优化和执行复杂的量子电路。它支持在本地模拟器和真实的IBM量子硬件等多种平台上运行,是实现量子机器学习、化学模拟和组合优化等高级算法的理想工具。
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标注数据管理工具
annotation-data
SharpAI/DeepCamera
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本工具用于管理和处理标注数据集,提供完整的CRUD(创建、读取、更新、删除)功能,支持标签管理和数据导出。核心功能包括支持COCO格式导出和Kaggle平台上传,旨在简化AI模型开发的数据处理流程,提升效率。
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Apify 错误排查指南
apify-common-errors
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本工具是用于诊断和解决Apify平台上运行爬虫和自动化任务时遇到的常见技术错误的指南。它涵盖了Actor运行失败、API限速(429)、认证失败(401)、反爬拦截和内存溢出等问题,为用户提供详细的诊断步骤和修复方案,确保爬虫流程的稳定性和健壮性。
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Apify安全基础指南
apify-security-basics
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本指南详细介绍了使用Apify平台时的安全最佳实践。涵盖了API Token的安全存储、环境隔离(开发/测试/生产)、代理凭证管理、Webhook验证流程,以及数据脱敏(PII)处理方法。帮助用户建立安全可靠的自动化数据爬取和处理流程。
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笔记平台跨平台迁移指南
apple-notes-migration-deep-dive
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本指南提供了全面的知识库迁移方案,涵盖了Apple Notes、Obsidian、Notion等主流笔记平台之间的内容迁移。它提供了基于JXA和Bash的脚本解决方案,旨在解决HTML格式转换、附件提取和平台兼容性等技术难题,帮助用户实现高效的知识流转。
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