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分子动力学模拟与分析

molecular-dynamics
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
303
本技能提供完整的分子动力学（MD）模拟流程，利用OpenMM等高性能工具模拟生物大分子在时间上的演变。其覆盖了系统构建、能量最小化、平衡化以及结构分析（如RMSD、自由能计算）等关键步骤。特别适用于结构生物学、药物结合模式研究和生物物理学分析。
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复杂网络与图谱分析

networkx
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
301
NetworkX是Python生态系统中的核心库，用于创建、分析和可视化复杂的网络图谱。它支持处理社会网络、生物网络、交通系统等多种关系结构。用户可以使用它计算最短路径、中心性、社区结构等高级图论算法，并支持多种数据格式的读写，是网络科学研究的必备工具。
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综合生物信号处理工具包

neurokit2
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
419
NeuroKit2是一个全面的Python生物信号处理工具包，用于分析和处理心电图（ECG）、脑电图（EEG）、皮肤电导（EDA）等多种生理信号。适用于心理生理学研究、复杂信号分析、心血管监测和运动分析等领域的深度数据挖掘。
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神经记录数据分析流程

neuropixels-analysis
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
241
这是一个为神经像素高密度电生理记录设计的端到端分析工具包。它基于SpikeInterface的最佳实践，覆盖了完整的分析工作流：包括数据加载（如SpikeGLX, NWB）、预处理、运动/漂移校正、尖峰排序（如Kilosort4）、计算质量指标和精细的单元精修。适用于神经科学研究。
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计算病理学全流程分析工具包

pathml
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
60
PathML是一个全面的计算病理学Python工具包，专为全流程病理图像分析设计。它支持加载160多种专有WSI格式，并提供从 stain 归一化、细胞核分割到构建空间图谱等核心功能。特别适用于多重免疫荧光和空间蛋白质组学的深度学习模型训练与大规模生物医学图像分析。
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科学论文同行评审

peer-review
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
378
这是一个用于进行科学论文和课题提案的系统性同行评审框架。它提供结构化、清单式的评估，涵盖方法论的严谨性、统计学有效性、报告标准（如CONSORT/STROBE）的符合度，并评估从摘要到结果的各个部分。适用于学术出版、科研质量评估和提供详细、建设性反馈。
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Qdrant分布式扩展与容量规划

qdrant-horizontal-scaling
github/awesome-copilot
204
本指南详细介绍了Qdrant向量数据库的扩展架构和容量规划的最佳实践。它指导用户何时进行垂直扩展或水平扩展，如何选择最佳的节点数和分片数量，并指导如何设置复制因子以确保系统的高可用性和零停机时间。同时也涵盖了分片管理和常见误区规避。
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学术作品评估与评阅

scholar-evaluation
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169
本技能提供一套系统化的学者评估框架（ScholarEval），用于对学术论文、研究提案和文献综述进行全面、结构化的评阅。它涵盖了研究问题、方法论、数据分析、写作表达等多个关键维度，提供定性和定量的评分和详尽的可行改进建议，帮助用户提升作品的学术质量和可发表性。
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科学证据与批判性思维评估

scientific-critical-thinking
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
363
本技能提供了一个系统的框架，用于评估科学声明、研究方法和证据的严谨性与质量。它指导用户评估实验设计有效性、识别各类偏差（如选择性、认知偏差），并应用GRADE或Cochrane风险评估等成熟框架。适用于系统综述、学术同行评审和批判性分析科学文献。
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稳定强化学习算法库

stable-baselines3
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
197
Stable Baselines3是一个基于PyTorch的专业级强化学习框架。它提供了PPO、SAC、DQN等一系列稳定且可靠的RL算法实现。用户可以使用它进行标准RL实验、快速原型开发，并支持构建和训练复杂的单智能体系统，包括自定义和向量化环境。
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TimesFM 零样本时间序列预测

timesfm-forecasting
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
314
使用 TimesFM 基础模型进行零样本时间序列预测。用户无需训练任何模型，即可对任何单变量时间序列（如销售、传感器数据）进行点预测和置信区间预测，支持高效的批量预测，并包含系统资源检查。
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模块化系统设计原则

modular-design-principles
tech-leads-club/agent-skills
461
本技能提供了一套跨技术栈的模块化设计指南，帮助用户理解和定义系统边界。它涵盖了界限上下文、状态隔离、显式契约和故障隔离等核心架构原则。适用于系统架构设计、服务拆分、耦合度评估或进行新模块开发，确保系统结构清晰、可维护、可扩展。
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