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Biopython分子生物工具包

biopython
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303
Biopython 提供序列操作、数据库访问、BLAST 自动化、结构生物信息和系统发育等功能，适合用于编写定制流水线和批量处理的计算分子生物学任务。
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bioRxiv 预印本搜索

biorxiv-database
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345
通过关键词、作者、日期和类别筛选 bioRxiv 预印本，输出结构化 JSON 元数据并可下载 PDF，便于文献综述与研究趋势追踪。
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生物服务跨库查询

bioservices
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119
BioServices 提供统一 Python 接口，调用几十个生信服务，便于跨库查询、ID 映射、通路与序列分析以及复合物检索，适用于整合型生物数据流程。
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BRENDA 酶数据库查询

brenda-database
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217
通过 BRENDA SOAP 接口获取酶的动力学参数、反应方程、底物特异性及环境条件，为生物化学研究、代谢通路构建与酶工程优化提供数据支撑。
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CELLxGENE普查查询助手

cellxgene-census
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274
通过程序化接口访问CZ CELLxGENE 61M+细胞数据，按组织、疾病及细胞类型查询表达、元数据、嵌入与统计，便于与scanpy或模型流程结合开展大规模分析。
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ChEMBL 生物活性查询

chembl-database
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通过 ChEMBL Python 客户端访问化合物、靶点、活性与药物数据，按结构/性质/活性过滤，支撑抑制剂发现与 SAR 分析。
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Cirq 量子计算工具

cirq
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Cirq 是 Google Quantum AI 的 Python 框架，用于构建、模拟与运行考虑噪声的量子电路，涵盖电路变换、仿真、实验模板和硬件整合流程，适合面向真实量子设备的开发。
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学术引文管理器

citation-management
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230
通过 Scholar 和 PubMed 搜索文献、提取完整元数据、校验引用并生成格式化 BibTeX，帮助科研写作保持引用准确。
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临床决策支持文档

clinical-decision-support
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301
为医药与临床研究生成出版级临床决策支持文档，涵盖生物标志物分层队列分析、证据分级治疗建议、统计对比及符合监管要求的 LaTeX/PDF 输出。
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临床报告撰写助手

clinical-reports
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
126
涵盖病例、诊断、试验与患者记录等各类临床报告的撰写需求，确保遵循CARE/ICH-GCP规范及HIPAA隐私要求，并在每份文档中生成 AI 科学示意图提升可视化。
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临床试验数据库查询

clinicaltrials-database
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324
通过 ClinicalTrials.gov API v2 按疾病、药物、地点、赞助商或状态查询试验，按 NCT 编号提取详细数据并导出用于研究分析、患者匹配或试验监控。
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ClinPGx 药物基因组数据库

clinpgx-database
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210
通过 ClinPGx REST API 查询基因-药物关系、CPIC/DPWG/FDA 指南、等位基因功能与频率等临床药物基因组数据，支持个体化用药与临床决策。
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