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搜索 Python ，共找到 212 条记录
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DNAnexus 云平台集成

dnanexus-integration
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338
结合 DNAnexus 云端组学平台，开发并配置生信 app，管理 FASTQ/BAM/VCF 等数据，执行工作流并通过 dxpy Python SDK 自动化脚本驱动分析流程。
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EDGAR 数据提取器

edgartools
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348
基于 Python 的库，访问并解析 SEC EDGAR 报送文件，提取 XBRL 财务表、Form4、13F 等结构化数据，支持 10-K/10-Q/8-K/DEF14A 等多种申报分析与公司筛选。
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FluidSim 流体仿真框架

fluidsim
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302
FluidSim 是一个面向周期域的 Python CFD 框架，提供 Navier-Stokes、浅水和分层流等求解器，结合 FFT、MPI、Pythran/Transonic 等高性能技术，内置参数配置、运行与输出分析可视化流程。
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统一基因组学命令行

gget
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447
gget 提供统一的命令行和 Python 接口，可以快速访问 20 多个基因组数据库，获取基因信息、BLAST 比对、AlphaFold 结构及富集分析结果，适合交互式探索和简单查询。
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Histolab 组织切片处理

histolab
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135
Histolab 在 Python 中自动检测组织、提取瓦片并标准化染色，帮助快速完成 WSI 数据集预处理与分析，适合轻量级流程，复杂空间蛋白组学等可转向 pathml。
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文档转Markdown工具

markitdown
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192
MarkItDown 将 PDF、Office 文档、图片、音频、HTML、CSV/JSON/XML、压缩包、YouTube 等内容转换为结构化 Markdown，提供 OCR、语音转写和 AI 图像描述等功能，便于 LLM 或文档流程使用。
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药化过滤工具集

medchem
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Medchem 是一个 Python 库，用于执行药物可行性规则、结构告警、复杂度评估和自定义约束，对化合物库进行并行筛选，辅助先导化合物优化与质量审查。
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网络分析工具包

networkx
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为社交、生物、交通等系统提供 Python 图网络构建、算法分析、生成、导入导出与可视化能力，方便探索实体关系与结构特征。
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OMERO 显微图像管理

omero-integration
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272
本技能通过 Python 接口连接 OMERO 服务器，遍历项目与图像、提取像素与 ROI、添加注释标签并运行批量分析，适用于高通量显微成像管理与计算流程。
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Pydicom 医学影像处理

pydicom
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Pydicom 提供 Python 接口，读取/写入 DICOM 医学影像、提取像素、修改元数据、匿名化、转换格式及处理压缩文件，适用于放射科影像分析与 PACS 集成等场景。
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通用实验室自动化框架

pylabrobot
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PyLabRobot 提供统一 Python 接口，驱动液体处理机器人、板式读取仪、泵、温控设备等多类实验室自动化硬件，适合多厂商协同、模拟验证和可复现实验流程。
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材料结构分析工具包

pymatgen
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Pymatgen 通过 Python 构建、转换和分析晶体结构，支持多种文件格式、能带和相图评估，并可调用材料项目数据库，适用于高通量材料计算工作流。
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