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Adaptyv 生物发现 API 集成
adaptyv
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
353
利用 Adaptyv 生物发现 API 和 Python SDK 设计蛋白质表征实验。支持成本估算、序列提交、进度监控及结果获取,适用于结合筛选和亲和力测定。需令牌认证及 Python 3.11+ 环境。
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Benchling 实验室数据集成
benchling-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
278
使用 Benchling Python SDK 与 v2 REST API 集成注册实体、库存、ELN 记录、工作流及数据仓库,实现实验室数据自动化导入、FASTA 序列创建、库存审计与事件驱动应用,支持 API Key 或 OAuth 认证。
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获取可用资源
get-available-resources
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
355
该技能检测主机资源库存,包括 CPU、内存、磁盘、调度器、容器和加速器限制,用于资源感知规划。生成脱敏 JSON 快照,无压力测试且不假设硬件可用性。支持 Python 3.11+ 及 Linux、macOS、Windows 系统。
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LabArchives API 集成
labarchive-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
360
安全对接 LabArchives 官方 ELN API 与 Inventory API v1:选择区域端点、构造 HMAC-SHA-512 签名请求、处理用户授权与 UID 流程,并用本地 Python 工具校验凭证与环境配置。
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Latch 生信工作流集成
latchbio-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
252
在 Latch 平台上使用 Python SDK、CLI、Nextflow、Snakemake、Latch Data、Registry 和 MCP 构建、注册、调试与运行生物信息学工作流,涵盖资源配置、数据管理、界面表单和任务监控。
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MATLAB 与 GNU Octave 工作流
matlab
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
209
用于设计、审查、迁移并安全规划 MATLAB 或 GNU Octave 数值工作流,涵盖数组、表格与时间数据、函数、测试、工程、绘图、MAT 文件及 Python 互操作,并强调产品许可与执行安全边界。
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Modal 无服务器 Python 平台
modal
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
495
Modal 是一个无服务器云平台,用于按需运行 Python 代码,包括 GPU 加速的 AI/ML 工作负载。适用于部署模型、提供 Web API、批处理任务和将 Python 应用程序扩展到云容器,支持从零到数千个实例的自动扩展。支持自定义容器镜像、持久化存储和亚秒级冷启动以实现低延迟推理。
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Python GPU 加速优化
optimize-for-gpu
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
54
利用 NVIDIA GPU 和 CUDA 加速科学 Python 代码。优化 NumPy、pandas、scikit-learn 等库的 GPU 执行性能。包含性能分析、内存管理和内核优化,确保结果正确并提升速度。
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Protocols.io 协议数据集成
protocolsio-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
243
读取、校验并安全导出 protocols.io 协议数据,支持官方 REST 接口与非执行式变更计划。内置 Python 客户端仅在显式 --execute 时发起受限的官方主机 GET 请求,默认离线运行。
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Pyzotero 文献库自动化管理
pyzotero
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
377
使用 pyzotero Python 客户端和 Zotero Web API v3 以编程方式管理 Zotero 文献库。可检索、新建、更新和删除条目、集合、标签与附件,支持库内搜索及 BibTeX、CSL-JSON 等引文导出,适用于文献管理与科研自动化流程。
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Qiskit 量子电路开发
qiskit
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
414
Qiskit 是一个用于构建、模拟和执行量子电路的 Python 框架。它支持本地模拟、噪声模拟以及 IBM 量子硬件执行。用户可利用 V2 原语(如 Sampler 和 Estimator)进行变分算法和量子机器学习任务。
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SimPy 离散事件仿真
simpy
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
278
Python 离散事件仿真库,支持构建和分析有界过程模型。涵盖事件、资源、中断和监控,适用于队列、物流和服务运营建模,提供可复现的输出分析与验证。
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