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可扩展基因调控网络推断

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使用 GRNBoost2/GENIE3 等可扩展算法，从 bulk 或单细胞表达数据中推断转录因子与靶基因关系，支撑大型转录组与 SCENIC 流程的调控网络分析。

DrugBank 数据洞察

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提供 DrugBank 的药物与靶点数据访问，涵盖数据下载、信息查询、药物相互作用网络、靶点与通路分析以及化学相似性比较，支持药理研究与临床安全评估。

STRING蛋白互作查询

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通过调用 STRING REST API 查询蛋白互作网络、映射标识符、生成带证据着色的网络图，并对蛋白列表执行 GO/KEGG/Pfam 富集，支持跨物种分析与网络扩展。

JASPAR转录因子结合位点工具

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通过调用 JASPAR API 和 Python 工具，获取 TF 结合模型、将 PFM 转为 PWM 并在 DNA 序列中扫描高置信度的结合位点，辅助调控变异注释、ChIP/ATAC 解读及转录因子网络构建。

PrimeKG 精准医学图谱

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通过 query_primekg.py 脚本查询 PrimeKG 精准医学知识图谱，覆盖基因、药物、疾病和表型的多尺度关系，可搜索实体、获取邻居、提取疾病上下文，并支持药物重定位与网络药理学分析。

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