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药物化学化合物筛选工具

medchem
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
357
这是一个用于药物发现领域的专业工具，提供全面的药物化学过滤功能。它能够基于药代动力学（如Lipinski规则）、结构警报（如PAINS, NIBR）和分子复杂性等多个维度，对化合物库进行高效筛选和优先级排序，帮助研究人员从大量化合物中筛选出有前景的候选药物。
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网络图分析与可视化工具包

networkx
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277
NetworkX是一个强大的Python库，用于创建、操作和分析复杂的图和网络结构。它内置了最短路径查找、中心性计算（如PageRank）、社区检测等核心图论算法，支持社会网络、生物信息学和交通系统等领域的复杂数据分析。
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系统发生树构建与分析工具包

phylogenetics
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496
本工具包提供完整的系统发生学分析流程，涵盖序列比对、数据精修和树状图构建。集成了MAFFT进行多序列比对，IQ-TREE 2和FastTree进行最大似然树推断。适用于分子基因组学、病毒进化追踪、蛋白质家族分析和分子时钟研究等领域，实现自动化生物信息学分析。
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PyTDC：药物发现机器学习数据集

pytdc
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114
PyTDC是一个开放科学平台，专门为药物发现和治疗领域提供标准化、可直接用于AI训练的权威数据集和基准。它支持单实例预测（如ADME、毒性）、多实例预测（药物-靶点相互作用DTI）以及分子生成等多种核心任务，是药物机器学习模型开发和性能评估的必备工具。
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生物数据分析工具包

scikit-bio
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282
scikit-bio是一个全面的Python库，专为生物信息学和生物数据分析设计。它提供强大的功能，用于处理DNA、RNA和蛋白质序列，执行复杂的序列比对，构建和分析系统发育树，并进行高级的生态学统计。核心能力包括计算多样性度量、进行降维分析（PCoA）以及处理多种生物学文件格式（如FASTA，Newick）。适用于微生物学、基因组学和生态学研究领域。
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scikit-survival：生存时间分析库

scikit-survival
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272
scikit-survival 是一个基于 scikit-learn 的专业 Python 库，用于进行生存分析和时间-事件建模。它专门处理存在审查数据的场景（如右删失数据），支持拟合 Cox 比例风险模型、随机生存森林和梯度提升模型等多种先进模型。用户可以利用库中的指标（如C-index）评估模型性能，适用于生命周期分析、临床研究和可靠性工程等领域。
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Python符号数学计算与求解

sympy
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SymPy是Python中的符号数学库，用于进行精确的数学计算。它可以处理代数运算、微积分（求导、积分）、线性代数、方程求解和物理模型等，所有计算都基于数学符号而非浮点数近似。适用于需要高精度、学术研究、科学建模的领域，并支持代码生成。
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通用科学数据库查询

database-lookup
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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该技能提供对78个公共科学数据库的REST API访问，覆盖生物医学、材料科学、物理学、环境科学和经济学等多个领域。用户可以根据查询目标（如化合物、基因、专利、经济指标等）选择数据库并执行API调用，适用于全面的科学研究和数据收集。
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导演-电影-演员三角定位法

actor-euro-triangulation
EverMind-AI/EverOS
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这是一种高级的推理技术，用于通过关联三个领域——导演信息、电影特征和演员生平细节——来间接定位和识别不为人知的演员。当直接搜索无法奏效时，该方法利用导演的代表作或电影背景作为切入点，实现身份的交叉验证和最终确认。
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高精度数学计算器

calculator
Code-and-Sorts/awesome-copilot-agents
302
该工具用于评估复杂的算术表达式，采用任意精度的小数数学计算，特别适用于金融、科学或工程领域。它能够避免标准浮点数运算导致的精度丢失问题，支持加减乘除、指数和括号运算。
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跨领域科研文献检索

ii-commons
sickn33/antigravity-awesome-skills
485
用于对学术研究和政策文件进行确定性、可复现的证据检索。支持搜索arXiv预印本、PubMed/PMC生物医学文献和美国政策语料库。提供语料库新鲜度检查、元数据查找和全文Markdown提取功能，确保研究结果的可靠性。
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文档到数学问题规范提取

doc2math
sickn33/antigravity-awesome-skills
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这是一个高级技能，用于将叙述性的技术文档、研究论文节选或自然语言问题描述，系统地转化为结构化的数学问题规范（MPS）。它能够精确提取变量、约束条件、优化目标和不确定性参数，并严格遵循零推理协议，确保所有输出内容均有原文证据支撑，适用于工程和数据科学领域的模型构建。
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