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Nextflow工作流管道开发与运行

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

Nextflow是一个强大的工作流语言和运行时，用于构建可复现、跨平台、可扩展的数据管道。它在生物信息学领域尤为重要，支持数据流编程，并能将工作流部署到高性能计算集群（HPC）和各类云平台。本书技能覆盖了从运行既有管道到开发自定义模块化工作流的全过程，保障了计算流程的可靠性和可重复性。

知识库快速构建与索引

meta-knowledge-base-bootstrap

opensquilla/opensquilla

这是一个元技能，用于从任何单一的种子源（如URL、PDF、Git仓库或纯文本）快速构建和启动一个领域知识库。它能自动完成四步流程：首先分类源类型，然后使用多引擎摄取内容，将摘要写入内存，最后生成结构化的Excel索引，确保信息可检索、可索引。

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