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Python
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Python交互式可视化绘图库
plotly
sickn33/antigravity-awesome-skills
429
Plotly是一个功能强大的Python绘图库,用于创建高度互动、可发布质量的可视化图表。它支持超过40种图表类型,涵盖散点图、热力图、K线图、地理地图等。非常适合构建复杂的交互式仪表板、进行深度探索性数据分析,或制作富含悬停、缩放等功能的网络演示。
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Modal云GPU:AI训练与推理平台
serverless-modal
wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep
53
本技能指导用户在Modal零配置服务器无服务器环境中运行GPU密集型机器学习任务。它详细介绍了从模型分析、成本估算到选择最佳GPU类型的全流程,支持训练、微调和推理等工作负载。其核心优势是实现环境的可复现性,用户无需本地GPU或复杂配置,即可快速进行ML实验。
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注释配置与审核队列管理
arize-annotation
github/awesome-copilot
133
本技能用于在Arize平台上创建和管理注释配置(如分类、连续、自由文本标签)和人工审核队列。它支持定义不同类型的标签结构,并允许用户通过Python SDK将人类反馈标签程序化地应用于项目跨度、数据集等,从而实现结构化的人工标注和模型监控。
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BigQuery 管道审计
bigquery-pipeline-audit
github/awesome-copilot
450
审计 Python 与 BigQuery 管道,识别成本风险、回填与循环设计、查询扫描、写入幂等性及可观测性缺陷,按函数和行定位问题并给出精简修复建议。
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时间序列机器学习工具箱
aeon
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
69
Aeon是一个兼容scikit-learn的Python时间序列机器学习工具包。它全面支持时间序列的多个核心分析任务,包括分类、回归、聚类、预测(Forecasting)、异常检测和相似性搜索。适用于所有涉及连续时间模式或时间索引复杂数据的分析场景。
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AnnData:单细胞注释数据结构
anndata
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
176
AnnData是一个专业的Python库,用于处理和分析注释化的矩阵数据,尤其适用于单细胞基因组学和生物信息学领域。它能高效存储实验测量值(X)和多维度的元数据(obs, var等)。本技能支持读取、写入、子集和拼接大型复杂数据集(如.h5ad、.zarr),是进行scRNA-seq分析和集成scverse生态系统的关键工具。
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基因调控网络推断
arboreto
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
55
Arboreto是一个强大的Python库,用于从各种基因表达数据集(如单细胞或批量RNA-seq)推断基因调控网络(GRN)。它利用GRNBoost2和GENIE3等算法,识别转录因子与目标基因之间的关键调控关系。支持Dask分布式计算,适用于大规模高通量转录组学分析。
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天体物理数据分析库
astropy
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
481
Astropy是用于天文学研究和天体物理数据处理的核心Python库。它提供了一系列功能,用于处理物理单位、进行天体坐标转换(如ICRS、银河系坐标)、操作FITS文件,执行宇宙学计算,以及处理精确时间。它是进行任何涉及天体坐标、单位转换或分析大型天文学目录的必备工具。
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综合分子生物学工具包
biopython
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
180
Biopython是基于Python的综合性计算分子生物学工具包,功能强大。它用于处理生物序列(DNA、RNA、蛋白质),解析FASTA、GenBank、PDB等标准生物学文件格式,并支持程序化访问NCBI等大型数据库。适用于构建复杂的生物信息学流程,如序列比对、结构分析和系统发育树构建。
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生物信息学数据分析
bioservices
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
437
这是一个功能全面的Python库,为超过40个主要的生物信息学网络服务和数据库提供了统一的编程接口。它专为复杂的生物学工作流设计,支持跨数据库查询(如UniProt、KEGG、ChEMBL)、ID映射、蛋白质序列检索、通路分析以及运行BLAST等序列相似性搜索,极大地简化了来自多个生命科学资源的数据集成过程。
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代谢模型与系统生物学分析
cobrapy
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
137
COBRApy是一个强大的Python库,用于约束性重构与分析(COBRA)。它支持进行代谢模型的构建、模拟和分析,特别适用于系统生物学研究。核心功能包括通量平衡分析(FBA)、通量变异分析(FVA)、基因或反应缺失突变体模拟,以及优化生长培养基。支持SBML、JSON、YAML等多格式代谢模型。
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Dask:分布式并行计算框架
dask
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
120
Dask是一个强大的Python库,用于实现并行和分布式计算。它允许用户将现有的Pandas和NumPy工作流扩展到超出可用内存的规模,从而高效处理高达TB级别的超大数据集。它提供了专门的API(DataFrame、Array、Bag),用于处理结构化、科学和非结构化数据,支持单机或集群部署。
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