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PubMed 数据库访问

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通过 PubMed 的 REST/API 接口构建布尔、MeSH 查询，按类型和时间等属性过滤文献，并借助 NCBI E-utilities 自动抓取摘要、引用和批量处理。

科学批判性思维

scientific-critical-thinking

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通过评估研究设计、统计合理性与偏见等，用 GRADE 和 Cochrane 框架判定证据质量，帮助研究者和审稿人识别方法学缺陷，确保结论建立在牢靠证据上。

Scikit-learn 机器学习指南

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使用 scikit-learn 构建经典机器学习流程的全面指导，涵盖监督/无监督算法、预处理、模型评估、调参和生产级流水线，适用于结构化与文本数据。

Python 生存分析工具集

scikit-survival

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基于 scikit-survival 的完整生存分析指南，涵盖删失数据处理、Cox/集成/SVM 模型构建以及 C 统计量、时间依赖 AUC、Brier 得分等评估，适用于临床和可靠性领域的时间事件建模。

Seaborn统计可视化

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Seaborn是基于matplotlib的Python统计可视化库，面向数据集提供分布、变量关系与类别对比的美观默认图表，便于快速探索与多面板输出。

Vaex 大数据分析

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Vaex 通过懒加载、磁盘外数据帧和高效聚合，令亿级行级别的 CSV/Arrow/Parquet 数据可视化、统计与机器学习处理成为可能，适用于无法全部载入内存的大型数据分析场景。

地理空间科学宝典

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GeoMaster 提供涵盖遥感、GIS、空间统计与机器学习的全链地理空间科学能力，支持卫星影像、点云、STAC与云原生流程，并配备 500+ 示例，适用于地表监测、流域建模等任务。

cBioPortal癌症基因组数据

cbioportal-database

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通过 cBioPortal REST API 查询 TCGA、GENIE 等肿瘤研究的突变、拷贝数、表达和生存数据，可用于癌基因验证、共突变模式分析与临床变量关联研究。

癌症依赖地图分析

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通过 DepMap API 或下载数据查询癌细胞基因依赖、药物敏感性与基因效应，发现肿瘤特异脆弱点、合成致死关系并验证靶点。

gnomAD 变异频率查询

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通过 gnomAD 的 GraphQL 接口获取人群等位基因频率、基因约束分数与 LoF 注释，支持罕见病变异解读与耐受基因识别。

GTEx 表达数据探索

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通过调用 GTEx 门户和 API 获取组织特异的基因表达、eQTL、sQTL 及变异调控数据，帮助解释 GWAS 位点并探索 54 种组织中的基因调控模式。

JASPAR转录因子结合位点工具

jaspar-database

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通过调用 JASPAR API 和 Python 工具，获取 TF 结合模型、将 PFM 转为 PWM 并在 DNA 序列中扫描高置信度的结合位点，辅助调控变异注释、ChIP/ATAC 解读及转录因子网络构建。

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