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BindingDB 亲和力查询

bindingdb-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
413
通过 BindingDB 的 REST 接口或下载表格获取药物-靶标的 Ki/Kd/IC50/EC50 亲和力数据，辅助靶点驱动的药物发现、SAR 分析、先导化合物评估和基准数据集构建。
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cBioPortal癌症基因组数据

cbioportal-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
131
通过 cBioPortal REST API 查询 TCGA、GENIE 等肿瘤研究的突变、拷贝数、表达和生存数据，可用于癌基因验证、共突变模式分析与临床变量关联研究。
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癌症依赖地图分析

depmap
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
127
通过 DepMap API 或下载数据查询癌细胞基因依赖、药物敏感性与基因效应，发现肿瘤特异脆弱点、合成致死关系并验证靶点。
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gnomAD 变异频率查询

gnomad-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
367
通过 gnomAD 的 GraphQL 接口获取人群等位基因频率、基因约束分数与 LoF 注释，支持罕见病变异解读与耐受基因识别。
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GTEx 表达数据探索

gtex-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
368
通过调用 GTEx 门户和 API 获取组织特异的基因表达、eQTL、sQTL 及变异调控数据，帮助解释 GWAS 位点并探索 54 种组织中的基因调控模式。
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InterPro蛋白注释工具

interpro-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
416
通过 InterPro REST API 与 Python 示例快速查询蛋白家族、结构域、功能位点等信息，支持功能预测、结构域组合分析以及 GO 注释，服务于蛋白组注释或进化研究流程。
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JASPAR转录因子结合位点工具

jaspar-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
259
通过调用 JASPAR API 和 Python 工具，获取 TF 结合模型、将 PFM 转为 PWM 并在 DNA 序列中扫描高置信度的结合位点，辅助调控变异注释、ChIP/ATAC 解读及转录因子网络构建。
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君主计划疾病知识库

monarch-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
258
通过 Monarch Initiative API 查询跨物种的疾病-基因-表现型关联，用于罕见病基因发现、表现型映射与模型生物数据整合的研究。
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单细胞RNA速度分析

scvelo
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
339
scVelo 使用未剪接和剪接转录本计数估算细胞状态流向，重构发育轨迹、潜在时间并识别驱动基因，常用于单细胞RNA测序的 Scanpy 流程中。
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系统发育分析流程

phylogenetics
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
128
使用MAFFT、IQ-TREE 2、FastTree等工具完成对齐、进化树构建与可视化，适用于微生物、病毒、蛋白家族等的系统发育与分子钟分析。
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AI健康分析器

ai-analyzer
sickn33/antigravity-awesome-skills
106
AI驱动的健康分析系统，整合多源数据识别异常、预测风险、提供个性化建议，并生成交互式报告，适合日常健康洞察与风险管理。
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数据可视化工具

data-visualization
sickn33/antigravity-awesome-skills
117
提供图表、地图和仪表盘等方式，将数据转化为清晰洞察，便于团队共享。
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