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健康经济学研究复现流程
jhe-replication-package
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
262
本指南旨在指导用户构建使用受限健康数据(如医疗索赔、EHR)的可复现研究包。它重点在于建立可信的数据访问路径、撰写详细的数据可用性声明(DAS)以及共享代码,确保研究流程的透明度和可信度,尤其适用于健康经济学领域的学术投稿。
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医疗健康机器学习会议投稿指南
machine-learning-for-health
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
126
本指南专为将机器学习应用于医疗健康领域的作者设计。它提供了一套完整的投稿策略,帮助作者将研究成果精准地定位到顶级AI会议的要求框架中,重点关注生物医学数据的处理、临床预测的有效性以及负责任的评估标准。
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自然生物医学工程投稿指南
nature-biomedical-engineering
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
458
本指南旨在帮助作者评估其生物医学工程研究是否符合《自然生物医学工程》的极高标准。内容覆盖了从研究的生物医学意义、临床验证的严谨性,到文章结构和投稿流程的完整指导,适用于医疗器械、生物材料和工程系统领域。
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临床AI模型卡片生成
authoring-model-cards
maziyarpanahi/openmed
112
用于为OpenMed临床NER或去识别化模型生成结构化的模型卡片。该功能能够整合复杂的评估结果(如性能指标、数据泄露率、子群公平性等),自动生成包含预期用途、局限性、详细指标和医疗设备免责声明的治理文档,确保临床AI的文档化和合规性。
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临床事件时间轴构建器
building-patient-timelines
maziyarpanahi/openmed
92
该工具能够从复杂的临床医疗记录中,提取并整合各种临床事件(如诊断、用药、手术)。它核心功能是进行时间归一化,解决相对时间表达(如“入院后两天”),生成一个按时间顺序排列的完整病程时间轴。该时间轴数据结构化,可直接用于UI展示或导出至FHIR标准资源。
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OpenMed医疗生物医学NLP开发指南
building-with-openmed
maziyarpanahi/openmed
356
本技能是使用OpenMed构建临床和生物医学NLP管线的综合指南。OpenMed是一个本地优先的Python库,用于执行实体识别(NER)、受保护的健康信息(PHI)脱敏和FHIR导出,所有操作均在设备本地运行,无需网络调用。当您开始新的临床文本项目,需要选择合适的OpenMed能力(如零样本NER、审计或FHIR转换),或需要核心功能入口时,请使用本指南。
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ICD-10编码辅助建议系统
coding-icd10
maziyarpanahi/openmed
195
该系统为医疗编码人员提供决策支持,负责将OpenMed提取的诊断和手术过程实体,映射到标准的ICD-10-CM和ICD-10-PCS编码。它能提供候选代码和详细的临床推理,帮助编码人员缩小搜索范围,预填病历,但最终的编码确认必须由专业人工审核。
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临床文本去标识化处理
deidentifying-clinical-text
maziyarpanahi/openmed
339
本技能用于本地设备上对临床自由文本进行去标识化处理。它可以移除、掩码、替换或哈希敏感的PHI/PII,支持多种方法(如日期偏移)。它确保了在共享、存储或分析医疗记录时,完全保护患者隐私,符合HIPAA和GDPR等严格的隐私标准。
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多语言临床文本脱敏处理
deidentifying-multilingual-text
maziyarpanahi/openmed
341
该技能专为处理多国语言的临床医疗文本设计,能够从西班牙语、德语、法语、阿拉伯语等多种语言的病历中脱去敏感的个人身份信息(PII)。系统能自动匹配语言对应的PII模型和国家级证件正则规则,并生成高度本地化的替代假数据,确保脱敏结果的真实性和可用性。
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提取DICOM元数据和报告文本
extracting-dicom-metadata
maziyarpanahi/openmed
136
本技能用于从DICOM影像文件中提取关键的患者元数据(如姓名、日期)和结构化报告文本。它解决了将医疗影像导入自然语言处理(NLP)流程的痛点,是进行数据脱敏和临床文本分析的必要前置步骤。
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文档结构化检验报告提取
extracting-lab-tables
maziyarpanahi/openmed
284
本技能能够自动检测并从扫描图像、照片、CSV/TSV等多种来源提取结构化的实验室表格面板。它将复杂的视觉报告数据转化为干净的结构化行记录,包含检验项名称、数值、单位、参考范围和异常标记。该功能是准备医疗数据进行LOINC/UCUM编码和映射至FHIR资源的关键前置步骤。
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FHIR术语服务查询与编码
querying-terminology-service
maziyarpanahi/openmed
392
该技能用于连接OpenMed提取的文本实体与最终的FHIR编码输出。通过调用用户持牌的FHIR术语服务器,实现临床代码的验证、值集扩展、代码查询和系统间映射(如ICD-10到SNOMED)。确保文本跨度能被转化为结构化、经过标准确认的编码概念,是医疗数据互操作性的关键环节。
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