下载

Skill UI

浏览并发现 7129+ 精选技能

全部编程开发人工智能设计创意产品商业数据科学市场营销职场通用效率工具硬件工程语言学习

搜索基因组，共找到 12 条记录

默认排序最新上传最多下载

ClinPGx 药物基因组数据库

clinpgx-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 ClinPGx REST API 查询基因-药物关系、CPIC/DPWG/FDA 指南、等位基因功能与频率等临床药物基因组数据，支持个体化用药与临床决策。

ClinVar 变异临床意义查询

clinvar-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

查询ClinVar数据库以获取变异临床意义，通过网页/API访问、FTP批量下载并注释VCF，辅助基因组医学解读。

DNAnexus 云基因组集成

dnanexus-integration

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 DNAnexus 云基因组平台开发 app/applet、管理 FASTQ/BAM/VCF 等数据、运行工作流，并使用 dxpy 自动化脚本，支撑生物医学流水线。

Ensembl基因组数据库接口

ensembl-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 Ensembl REST API 获取 250+ 物种的基因注释、序列、变异、同源基因及装配坐标映射，便于整合入基因组研究流程。

基因组区间嵌入

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

Geniml面向BED及scATAC-seq数据，用机器学习学习区域、元数据和细胞嵌入，支持相似度搜索、聚类、共识峰构建等基因组区间分析流程。

基因组区间工具库

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

高性能 Rust 工具库（含 Python 绑定），面向基因组区间分析，支持重叠检测、覆盖轨道、ML 标记化、参考序列管理、片段拆分与评分等常见测序数据流程。

KEGG REST 工具集

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

提供 KEGG REST API 的 Python 工具，涵盖数据库信息、列表、检索、搜索、ID 转换、关联与药物交互，帮助完成通路与基因组分析。

Pysam基因组分析工具

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

Pysam 提供 htslib 的 Python 接口，可读写 SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FASTQ，便于提取区域、计算覆盖、分析变异，并支持 NGS 流水线集成。

TileDB VCF 变体存储

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

TileDB-VCF 使用 TileDB 稀疏数组高效管理 VCF/BCF 变异数据，支持增量样本、并行区域查询、云本地存储与导出，适合群体基因组分析与变异数据库构建。

cBioPortal癌症基因组数据

cbioportal-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 cBioPortal REST API 查询 TCGA、GENIE 等肿瘤研究的突变、拷贝数、表达和生存数据，可用于癌基因验证、共突变模式分析与临床变量关联研究。

系统发生树重建与分析工具包

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

这是一个完整的系统发生学分析流程，用于重建生物序列（基因、蛋白质）的进化关系。流程涵盖了从多序列比对（MAFFT）到最大似然树构建（IQ-TREE 2），再到可视化和分析（ETE3）的完整生命周期。适用于病毒动力学、微生物基因组学、分子时钟分析等前沿生物信息学研究。

Polars Bio基因组工具

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

polars-bio 依托 Polars、Arrow 与 DataFusion，提供高性能基因组区间运算、BED/VCF/BAM/CRAM/GFF/FASTA 等生信文件读写、SQL 查询及流式处理，适合云存储与大文件场景，可替代 bioframe。

1

语言