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基于HTML/CSS的研究海报制作

pptx-posters
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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本技能用于创建基于HTML/CSS的学术研究海报，支持导出为PDF或PPTX格式。它提供现代、响应式的布局，并指导用户生成视觉元素，确保海报内容简洁、文字巨大且高对比度，从而保证从远距离观看时的极佳可读性。
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PyDESeq2：RNA-seq差异表达分析

pydeseq2
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这是一个基于Python的工具包，用于对批量RNA-seq计数数据进行差异基因表达分析。它支持从多种格式加载数据，并处理复杂的单/多因素设计（如校正批次效应）。用户可以执行完整的DESeq2统计流程，包括标准化、拟合和进行严格的Wald检验。非常适合将生物信息学分析流程从R语言迁移到Python环境。
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DICOM医学影像数据处理

pydicom
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这是一个用于处理DICOM（数字影像和通信在医学中）文件的Python库。它支持读取、写入和修改CT、MRI、X光等医学影像数据，功能包括元数据提取、像素数据处理、数据匿名化（移除个人身份信息）、多格式转换以及多帧图像处理，是医学数据分析和PACS系统集成的关键工具。
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基因组数据处理与分析

pysam
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Pysam是一个专业的基因组数据处理Python模块。它提供了一个Python接口，用于读写和操作主流基因组格式，包括BAM/CRAM比对文件、VCF/BCF变异文件和FASTA/FASTQ序列。广泛应用于基因组测序分析、变异检测、覆盖度计算以及构建复杂的生物信息学流程。
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RDKit化学信息学分子工具包

rdkit
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RDKit是一个功能强大的开源化学信息学库，提供全面的Python API，用于分子结构分析和操作。它支持读取和写入多种分子格式（如SMILES、SDF），计算理化描述符、指纹图谱，并执行子结构搜索、立体化学分析等。该工具集是药物发现、计算化学和材料科学研究的关键资源。
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竞争性科研基金提案撰写

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本技能用于指导用户为主要的科研基金机构（如NSF、NIH、DOE、DARPA、NSTC等）撰写具有竞争力的研究提案。它全面涵盖了提案的关键组成部分，包括项目意义、创新性叙述、预算规划、以及遵守各机构特定格式和要求，旨在帮助学术和研发人员提高提案的成功率。
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单细胞RNA测序分析

scanpy
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这是一个功能全面的Python工具包，用于执行从原始数据到最终细胞类型注释的单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析。它支持质量控制（QC）、数据标准化、降维（PCA/UMAP/t-SNE）、细胞聚类和差异基因表达分析等全流程。用户可以使用内置的脚本处理多种格式的数据，生成高质量的生物学图谱和注释报告。
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学术论文科学可视化

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用于创建符合学术期刊要求的专业级科学图表。该技能指导用户掌握科学数据的可视化最佳实践，包括复杂的多面板布局、错误条的准确展示、色盲友好色谱的使用，以及遵循如Nature、Science等主流期刊的排版和导出规范。确保图表在不同格式和分辨率下保持最高质量。
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生物信息学数据分析工具

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这是一个全面的Python生物信息学工具包，用于处理和分析生物学数据。核心功能包括DNA/RNA/蛋白质序列操作、配对和多重序列比对、构建和分析系统发育树，以及计算Alpha/Beta多样性等生态学指标。适用于微生物组学分析、进化学研究和各种生物数据处理，支持FASTA、Newick等标准格式。
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综合统计分析工具

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提供从假设检验到专业报告的完整统计分析流程。支持选择合适的统计模型（如t检验、方差分析、回归分析），自动检查数据假设，计算效应量，并生成符合APA格式的学术报告，适用于学术研究和深入的数据探索。
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医疗治疗方案撰写

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该工具可为所有临床科室生成高度聚焦、证据支持的医疗治疗方案（LaTeX/PDF格式）。方案强调简洁性、可操作性和HIPAA合规性，适用于慢性病管理、康复治疗和精神卫生等领域，确保制定结构化的护理路径，并自动纳入AI生成的科学示意图。
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科学出版模板与投稿指南

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本技能提供全面、专业的LaTeX模板、格式要求和详细的投稿指南，适用于各大科学期刊（如Nature、Science）、国际学术会议（如NeurIPS、ICML）的论文，以及科研海报和基金提案。使用本技能可以确保您的学术成果符合目标出版机构的特定规范，大大提高投稿成功率和效率。
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