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搜索蛋白，共找到 18 条记录

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Adaptyv生物工厂API

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介绍如何借助 Adaptyv Bio Foundry API 与 Python SDK 提交蛋白序列、估算费用、自动确认报价，并获取结合与热稳定性等实验数据的实用流程。

AlphaFold结构访问

alphafold-database

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通过 UniProt 编号获取 AlphaFold 预测的蛋白质结构，下载 mmCIF/PDB 文件，分析 pLDDT/PAE 置信度，并用于结构分析或药物研发流程。

Benchling 实验平台集成

benchling-integration

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通过 Benchling SDK/REST 接口自动化管理 DNA、RNA、蛋白等注册实体、库存、ELN 条目与工作流，并可与外部系统及数据仓库同步，适合实验室数据集成场景。

DiffDock 分子对接

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DiffDock 用扩散模型预测蛋白-配体结合构象与置信度，支持PDB结构、序列及SMILES/SDF输入，适合单复合体对接和批量虚拟筛选，用于基于结构的药物发现。

蛋白质语言建模套件

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基于 ESM 的蛋白质语言模型工具包，集合序列生成、结构预测、嵌入提取、功能条件化与 Forge 批量推理，服务蛋白工程与表示任务。

Histolab 组织切片处理

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Histolab 在 Python 中自动检测组织、提取瓦片并标准化染色，帮助快速完成 WSI 数据集预处理与分析，适合轻量级流程，复杂空间蛋白组学等可转向 pathml。

PDB结构浏览器

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通过 RCSB PDB 搜索蛋白或核酸结构、下载 PDB/mmCIF/Binary 坐标文件、获取实验元数据并批量处理，为药物发现、蛋白工程和结构生物学提供数据支撑。

PyOpenMS 质谱分析平台

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PyOpenMS 通过 Python 接口调用 OpenMS，面向蛋白质组和代谢组全流程，从文件读写、信号处理、特征检测到鉴定定量，并可与 pandas/可视化工具整合。

云原生分子建模工作流平台

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Rowan 通过 Python 接口提供 pKa 预测、构象/互变异构体生成、对接、蛋白-配体共折叠与描述符等云原生分子建模能力，适合批量化学筛选与多步骤管道，无需本地高性能集群。

STRING蛋白互作查询

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通过调用 STRING REST API 查询蛋白互作网络、映射标识符、生成带证据着色的网络图，并对蛋白列表执行 GO/KEGG/Pfam 富集，支持跨物种分析与网络扩展。

TorchDrug 分子图神经

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TorchDrug 是基于 PyTorch 的图神经网络工具箱，覆盖分子与蛋白数据、知识图谱、分子生成与逆合成，方便用户自定义 GNN 模型进行药物性质预测和合成路径规划。

UniProt数据库接口

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通过 UniProt REST API 搜索蛋白质、获取 FASTA 与注释、执行 ID 映射并流式下载，适合 Python 工作流和批量分析。

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