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LaTeX学术研究海报制作指南
latex-posters
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
484
本指南全面指导用户使用LaTeX创建专业、高质量的学术研究海报。内容覆盖学术布局、排版和色彩方案的最佳实践。更重要的是,它为AI生成视觉元素提供了严格的指导原则,强调内容极简、高对比度和低密度,确保海报的视觉传达效果达到最佳。
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质谱数据分析与化合物鉴定
matchms
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
486
Matchms是一个开源的Python库,用于全面的质谱数据处理和分析。它支持导入多种格式的谱图,核心功能包括计算谱图相似性得分、进行数据标准化过滤,并帮助用户在代谢组学等领域识别未知化合物。
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Matplotlib:Python科学绘图库
matplotlib
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
233
Matplotlib是Python核心的可视化库,用于创建高度定制化的静态、动态和交互式图表。它支持多种图表类型(如折线图、散点图、热力图、3D图),提供面向对象和pyplot两种接口。适用于科研数据分析、生成高质量出版物图表以及构建复杂的子图布局。
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Modal:AI/ML无服务器云平台
modal
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
392
Modal是一个专为AI和机器学习工作负载设计的无服务器云平台。它允许用户部署、服务和扩展复杂的模型(如大型语言模型),而无需手动管理底层基础设施。核心功能包括按需接入高端GPU资源、无服务器函数自动伸缩、提供持久化存储,并且整个基础设施都可以纯代码定义,极大简化了开发流程。
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分子动力学模拟与分析
molecular-dynamics
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
303
本技能提供完整的分子动力学(MD)模拟流程,利用OpenMM等高性能工具模拟生物大分子在时间上的演变。其覆盖了系统构建、能量最小化、平衡化以及结构分析(如RMSD、自由能计算)等关键步骤。特别适用于结构生物学、药物结合模式研究和生物物理学分析。
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神经记录数据分析流程
neuropixels-analysis
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
241
这是一个为神经像素高密度电生理记录设计的端到端分析工具包。它基于SpikeInterface的最佳实践,覆盖了完整的分析工作流:包括数据加载(如SpikeGLX, NWB)、预处理、运动/漂移校正、尖峰排序(如Kilosort4)、计算质量指标和精细的单元精修。适用于神经科学研究。
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OMERO显微镜数据管理与分析
omero-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
159
该技能提供OMERO平台的综合Python API接口,用于管理和分析大规模显微镜数据集。用户可以通过编程方式访问图像、检索结构化数据、分析原始像素数据、管理感兴趣区域(ROIs)和复杂注释,执行批处理工作流,特别适用于高通量筛选和生物学研究。
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科学Python GPU加速优化
optimize-for-gpu
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
184
此技能旨在将CPU密集型的Python代码转化为高性能的GPU加速代码,利用NVIDIA技术实现科学计算领域的加速。它擅长处理机器学习、物理模拟、地理空间分析和大型数值计算等场景。通过使用CuPy、Numba CUDA和Warp等专业工具,可以实现对NumPy、SciPy等核心库的优化,从而达到数倍到千倍的性能提升。
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Polars:高性能数据处理框架
polars
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Polars是基于Apache Arrow构建的高性能Python DataFrame库。它提供基于表达式的API和惰性查询优化,专为高效的ETL、数据分析和复杂数据管道设计。无论是在进行数据清洗、聚合计算,还是处理大规模数据集,Polars都能提供卓越的性能和优化能力。
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基因组数据操作与分析
polars-bio
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
184
这是一个基于Polars的高性能基因组数据处理库。它支持核心区间运算(如重叠、合并、互补)以及主流生物信息学文件格式(如VCF、BAM、BED、GFF)的读写。特别适用于处理超大型、无法一次性加载到内存的基因组数据集,支持流式和云端存储I/O。
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高性能强化学习框架
pufferlib
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
325
PufferLib是一个高性能、可扩展的强化学习框架,专为大规模并行训练和向量化模拟设计。它集成了PuffeRL算法和PufferEnv API,支持多智能体系统和自定义环境创建,实现业界领先的高速性能。适用于大型AI研究和大规模实验。
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质谱分析与数据处理平台
pyopenms
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
391
这是一个基于Python的质谱分析计算平台,专为蛋白质组学和代谢组学工作流设计。它支持从原始MS数据到鉴定、定量(包括无标签和等位素定量)的完整分析流程,能够处理复杂的LC-MS/MS数据,是生物信息学研究的强大工具。
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