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QuTiP 量子工具箱

qutip
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QuTiP 是面向研究与教学的 Python 量子模拟库，提供求解器、物理量分析、可视化及高级算法，适合研究开放系统、Lindblad 动力学、退相干与量子光学场景。
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RDKit 化学信息学工具

rdkit
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RDKit 提供 Python 接口读取/写入 SMILES/SDF/InChI，控制分子规范化，计算描述符与指纹，执行子结构搜索、化学反应与可视化，适用于药物发现与计算化学研究。
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科研资助申请撰写

research-grants
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为NSF、NIH、DOE、DARPA和NSTC等机构撰写科研资助申请，涵盖机构要求、项目叙述、预算与意义陈述，配合AI生成的科研示意图提升竞争力。
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云原生分子建模工作流平台

rowan
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Rowan 通过 Python 接口提供 pKa 预测、构象/互变异构体生成、对接、蛋白-配体共折叠与描述符等云原生分子建模能力，适合批量化学筛选与多步骤管道，无需本地高性能集群。
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科研示意图自动生成

scientific-schematics
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借助 Nano Banana 2 AI 生成科研示意图，Gemini 3.1 Pro 按文档类型审核质量并智能迭代，帮助快速完成期刊、海报、报告、演示等场景的出版级图示。
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微生物组生物信息工具包

scikit-bio
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scikit-bio 是一款 Python 生物数据工具库，涵盖序列处理、比对、系统发育树、微生物多样性指标、群落统计与排序分析，适用于需要处理 FASTA/Newick 文件与生态多样性统计的研究流程。
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单细胞生成建模工具

scvi-tools
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提供基于 PyTorch 的概率生成模型，面向单细胞 RNA、ATAC、空间与多模态数据，自动校正批次效应、支持不确定性差异分析，便于与 scanpy 流程对接。
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SimPy离散事件仿真

simpy
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SimPy 是基于 Python 的离散事件仿真框架，适用于制造、物流、服务、网络等场景中建模队列、资源竞争和进程交互，帮助在实现前验证系统行为与容量。
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统计分析引导

statistical-analysis
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本技能引导研究者完成假设检验、回归、相关与贝叶斯分析，附带前提假设检验、功效评估与APA格式报告，帮助选对分析方法并清晰呈现研究结果。
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Statsmodels统计建模与计量

statsmodels
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Statsmodels 提供 Python 环境下的回归、GLM、混合效应和时间序列模型，配套假设检测、残差分析、模型比较与预测，适合计量经济与科研级推断需求。
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Python 符号数学

sympy
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在 Python 中使用 SymPy 处理符号代数、微积分、线性代数、物理和数论问题，支持几何、代码生成等场景，适合需要精确符号结果的数学推导与公式转换。
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TileDB VCF 变体存储

tiledbvcf
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TileDB-VCF 使用 TileDB 稀疏数组高效管理 VCF/BCF 变异数据，支持增量样本、并行区域查询、云本地存储与导出，适合群体基因组分析与变异数据库构建。
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