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DNAnexus 云平台集成

dnanexus-integration
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416
结合 DNAnexus 云端组学平台，开发并配置生信 app，管理 FASTQ/BAM/VCF 等数据，执行工作流并通过 dxpy Python SDK 自动化脚本驱动分析流程。
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ENA序列访问

ena-database
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通过 REST 接口或 FTP 访问欧洲核苷酸档案库，快速获取 DNA/RNA 序列、原始读段、组装体、注释和分类信息，便于科研或生信流水线集成。
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系统发育树工具包

etetoolkit
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ETE 工具包提供系统发育树操作、进化事件检测、NCBI 分类信息集成以及高质量图形化展示，助力系统发育组学研究与聚类分析。
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FRED经济数据接口

fred-economic-data
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通过 FRED API 获取涵盖 GDP、就业、通胀、利率及区域等 80 多万个经济序列，适用于宏观分析、金融研究、政策评估与经济预测等场景。
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GEO基因表达提取器

geo-database
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连接NCBI GEO仓库，通过Entrez搜索GSE/GSM/GPL/Profiles，获取基因表达数据、实验设计和矩阵文件，配合GEOparse下载分析所需的转录组资料。
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统一基因组学命令行

gget
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gget 提供统一的命令行和 Python 接口，可以快速访问 20 多个基因组数据库，获取基因信息、BLAST 比对、AlphaFold 结构及富集分析结果，适合交互式探索和简单查询。
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Gtars基因组分析工具

gtars
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Gtars 是一个高性能 Rust 工具包，配套 Python 绑定，用于基因组区间分析，涵盖重叠检测、覆盖曲线生成、机器学习 token 化、片段打分与参考序列管理等计算基因组学场景。
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GWAS目录访问

gwas-database
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通过 GWAS 目录网页或 REST 接口查询 SNP 与性状关联，获取研究、变异、性状信息及统计结果，支撑遗传流行病学与多基因风险模型研究。
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OFR对冲基金监控

hedgefundmonitor
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无需密钥即可调用OFR对冲基金开放接口，获取规模、杠杆、对手方、流动性与风险管理等系列时间数据，适合系统性风险监测与金融研究。
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人类代谢物数据库查询

hmdb-database
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通过 HMDB 检索 22 万余条人类代谢物信息，可按名称、ID、结构、疾病、标本筛选，获取化学、临床、通路和谱图数据并批量下载，支持代谢组学研究与生物标志物分析。
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科学假设生成

hypothesis-generation
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在观察或文献基础上构建可检验的科学假设、设计实验、对比解释与制定预测，并要求配合 AI 生成的科学图示完成分析报告。
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智能信息图制作器

infographics
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通过 Nano Banana Pro+Gemini 3 Pro 联动，配合自动调研与智能迭代，迅速生成满足不同用途质量阈值的专业级信息图。
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