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Denario科研流程助手

denario
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201
Denario通过多智能体协作，自动化科研流程，从数据洞察、方法构建到计算实验和LaTeX论文生成，全程支撑研究交付。
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DiffDock 分子对接

diffdock
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431
DiffDock 用扩散模型预测蛋白-配体结合构象与置信度，支持PDB结构、序列及SMILES/SDF输入，适合单复合体对接和批量虚拟筛选，用于基于结构的药物发现。
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DrugBank 数据洞察

drugbank-database
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439
提供 DrugBank 的药物与靶点数据访问，涵盖数据下载、信息查询、药物相互作用网络、靶点与通路分析以及化学相似性比较，支持药理研究与临床安全评估。
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EDGAR 数据提取器

edgartools
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基于 Python 的库，访问并解析 SEC EDGAR 报送文件，提取 XBRL 财务表、Form4、13F 等结构化数据，支持 10-K/10-Q/8-K/DEF14A 等多种申报分析与公司筛选。
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ENA序列访问

ena-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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通过 REST 接口或 FTP 访问欧洲核苷酸档案库，快速获取 DNA/RNA 序列、原始读段、组装体、注释和分类信息，便于科研或生信流水线集成。
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FDA监管数据查询

fda-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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通过 Python 调用 openFDA 接口查询药品、器械、食品、兽药及物质的监管、召回、安全与上市信息，辅助合规分析与药物安全研究。
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FRED经济数据接口

fred-economic-data
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通过 FRED API 获取涵盖 GDP、就业、通胀、利率及区域等 80 多万个经济序列，适用于宏观分析、金融研究、政策评估与经济预测等场景。
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AI 图像生成助手

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通过 OpenRouter 的 Gemini 3.1 Flash 与 Flux.2 Pro 模型，运行脚本并配置提示、原图、输出路径、模型与 API 密钥，即可快速生成或编辑照片、插画、概念图等通用视觉素材。
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GeoPandas空间分析工具

geopandas
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GeoPandas 在 pandas 基础上提供地理矢量数据处理能力，可读写多种格式、投影、空间连接与叠加、缓冲与可视化，适合街区分析、地图制作与 PostGIS 集成工作。
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统一基因组学命令行

gget
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gget 提供统一的命令行和 Python 接口，可以快速访问 20 多个基因组数据库，获取基因信息、BLAST 比对、AlphaFold 结构及富集分析结果，适合交互式探索和简单查询。
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GWAS目录访问

gwas-database
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通过 GWAS 目录网页或 REST 接口查询 SNP 与性状关联，获取研究、变异、性状信息及统计结果，支撑遗传流行病学与多基因风险模型研究。
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Histolab 组织切片处理

histolab
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Histolab 在 Python 中自动检测组织、提取瓦片并标准化染色，帮助快速完成 WSI 数据集预处理与分析，适合轻量级流程，复杂空间蛋白组学等可转向 pathml。
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