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Plotly 交互式图表

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Plotly 是 Python 交互式图形库，适合数据探索、仪表盘与汇报，支持提示、缩放、动画和多种导出格式。

PufferLib 高性能强化学习

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PufferLib 是一个高性能强化学习框架，适合需要并行模拟、向量化环境和多智能体训练的场景，可实现百万步/秒级 PPO 训练，并与 Gymnasium、Atari、Procgen 等环境无缝集成。

PyDESeq2 差异表达分析

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PyDESeq2 是在 Python 中复现 DESeq2 的差异表达分析工具，可载入 bulk RNA-seq 计数、过滤低表达基因、指定单/多因素设计、执行 Wald 检验并进行 LFC 收缩，方便结合 pandas/AnnData 管道输出结果和可视化。

Pymoo 多目标优化框架

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Pymoo 是一个 Python 多目标优化框架，提供 NSGA-II/III、MOEA/D 等算法、可定制遗传操作、标准测试集与可视化工具，帮助工程设计在冲突目标下寻找 Pareto 解并处理约束问题。

PyTorch Lightning训练流程

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PyTorch Lightning 规范模块、数据、回调与 Trainer 设置，支持多 GPU/TPU 和分布式策略，方便追踪与调度训练流程。

Qiskit量子计算框架

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Qiskit是一个开源量子计算框架，用于构建量子电路、优化与硬件执行，并对结果进行可视化分析。通过pip安装后即可连接IBM Quantum与第三方后端，支持误差缓解与算法库。

RDKit 化学信息学工具

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RDKit 提供 Python 接口读取/写入 SMILES/SDF/InChI，控制分子规范化，计算描述符与指纹，执行子结构搜索、化学反应与可视化，适用于药物发现与计算化学研究。

科研资助申请撰写

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为NSF、NIH、DOE、DARPA和NSTC等机构撰写科研资助申请，涵盖机构要求、项目叙述、预算与意义陈述，配合AI生成的科研示意图提升竞争力。

云原生分子建模工作流平台

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Rowan 通过 Python 接口提供 pKa 预测、构象/互变异构体生成、对接、蛋白-配体共折叠与描述符等云原生分子建模能力，适合批量化学筛选与多步骤管道，无需本地高性能集群。

Scanpy 单细胞分析流程

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Scanpy 以 AnnData 为基础，构建可扩展的单细胞 RNA-seq 分析流程，涵盖质控、归一化、降维、聚类、标记基因发现、细胞注释、轨迹推断与出版级可视化，适用于探索型 scRNA-seq 研究。

科学头脑风暴指南

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作为科研思维伙伴，围绕跨学科类比、逆向假设与方案评估展开对话式头脑风暴，帮助梳理方向、识别突破点并规划下一步实验。

科研示意图自动生成

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借助 Nano Banana 2 AI 生成科研示意图，Gemini 3.1 Pro 按文档类型审核质量并智能迭代，帮助快速完成期刊、海报、报告、演示等场景的出版级图示。

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