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Python
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Adaptyv 蛋白质实验平台
adaptyv
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
212
引导如何使用 Adaptyv Bio Foundry API 与 Python SDK 设计蛋白实验、提交序列、自动化流程,并获取 BLI/SPR 与热稳定性等检测结果,适合需要采集实验数据的开发者与科研人员。
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注释数据矩阵
anndata
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
451
AnnData 提供面向单细胞和注释数据的 Python 容器,支持在一个对象里管理数据矩阵与多维元数据,读取/写入 h5ad/zarr/loom/10X 等格式,并与 scverse 工具配合执行大规模分析。
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Benchling 实验室集成套件
benchling-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
266
通过 Benchling SDK/REST 管理 DNA/RNA/蛋白等注册实体、库存、ELN、流程与数据仓库查询,实现实验室数据同步与自动化。
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Biopython分子生物工具包
biopython
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
303
Biopython 提供序列操作、数据库访问、BLAST 自动化、结构生物信息和系统发育等功能,适合用于编写定制流水线和批量处理的计算分子生物学任务。
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Cirq 量子计算工具
cirq
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
81
Cirq 是 Google Quantum AI 的 Python 框架,用于构建、模拟与运行考虑噪声的量子电路,涵盖电路变换、仿真、实验模板和硬件整合流程,适合面向真实量子设备的开发。
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COBRApy 代谢建模分析
cobrapy
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
496
COBRApy 是面向系统生物学和代谢工程的 Python 工具,支持加载 SBML/JSON/YAML 模型、执行 FBA/FVA/采样、分析基因或反应敲除,并探索培养基与产物相位平面。
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Dask 大数据并行处理
dask
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
395
Dask 是 Python 库,通过并行化 DataFrame、Array、Bag 以及自定义任务,把 pandas/NumPy 工作流扩展到超出内存的规模,可在多核或集群上完成 ETL、日志处理和分布式 ML。
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EDGAR 数据提取器
edgartools
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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基于 Python 的库,访问并解析 SEC EDGAR 报送文件,提取 XBRL 财务表、Form4、13F 等结构化数据,支持 10-K/10-Q/8-K/DEF14A 等多种申报分析与公司筛选。
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FluidSim 计算流体框架
fluidsim
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
461
FluidSim 是基于 Python 的高性能计算流体力学框架,提供 Navier-Stokes、浅水与分层流的伪谱求解器,集成 FFT、MPI 及输出分析/可视化,适用于湍流、涡旋与地球流体模拟。
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统一生物信息查询工具
gget
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
488
gget 提供命令行和 Python 接口,统一访问 20 多个生物信息数据库,可交互或脚本化查询基因、序列、BLAST、结构与富集等信息。
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Latch 生物信息工作流
latchbio-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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LatchBio Integration 提供 Python 为核心的服务器化生物信息流程构建与部署能力,涵盖装饰器任务、LatchFile/Dir 云存储、GPU 资源调优,以及与 Nextflow/Snakemake 等管道的互通,适合 RNA-seq、AlphaFold 等分析场景。
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医药化学筛选工具
medchem
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
219
Medchem 是面向药物发现的 Python 库,提供药性规则、结构警报、官能团检测、标准目录、复杂度评估与自定义约束,帮助批量筛选化合物库并优先挑选候选分子。
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