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网络图分析工具包

networkx
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Python工具包,用于构建、分析和可视化复杂网络,提供算法、读写、生成及社区检测能力,适用于社交、生物、交通、引文等实体关系场景。
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OMERO显微镜数据集成

omero-integration
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通过 OMERO Python API 管理显微镜数据：访问项目/数据集/图像、分析像素、运维 ROI 与注释、保存表格结果，并支持高内涵筛选的批处理自动化流程。
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Opentrons协议自动化集成

opentrons-integration
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提供官方 Opentrons Protocol API v2 接口，支持在 OT-2 与 Flex 机器人上编写 Python 协议，自动化液体处理、模块控制、上样板配置与复杂移液流程，并在执行前模拟测试。
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Python实验室机器人自动化框架

pylabrobot
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PyLabRobot是一个纯Python、厂商无关的实验室自动化开发工具包。它提供了一个统一的接口，用于控制各种实验室设备，如液体处理机器人（Hamilton, Opentrons, Tecan）、读板机、泵、摇架和培养箱。适用于构建复杂、多设备、可复现的自动化实验流程，并支持离线仿真。
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Pymoo 多目标优化框架

pymoo
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Python 框架，集成 NSGA-II/III、MOEA/D 等多目标与约束优化算法，支持基准问题、定制算子与帕累托前沿可视化，适合工程设计与多方案决策。
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PyOpenMS 质谱分析平台

pyopenms
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PyOpenMS 通过 Python 封装 OpenMS，支持 mzML 等格式读取、信号处理、特征和肽段/蛋白鉴定、定量及代谢组分析等质谱计算流程。
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云原生分子建模工作流平台

rowan
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Rowan 通过 Python 接口提供 pKa 预测、构象/互变异构体生成、对接、蛋白-配体共折叠与描述符等云原生分子建模能力，适合批量化学筛选与多步骤管道，无需本地高性能集群。
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SymPy 符号计算

sympy
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提供 SymPy 的符号数学指导，涵盖代数表达式化简、微积分、方程求解、线性代数、物理计算、数论与几何等场景，帮助输出精确符号结果并生成可执行代码。
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USPTO 专利及商标数据库

uspto-database
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通过 PatentSearch、PEDS、TSDR 等 USPTO 数据接口，支持按关键词、发明人、权利人、分类与日期检索专利和商标、查看审查、状态与转让记录，便于开展知识产权分析与资产运营。
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Zotero文献管理Python封装

pyzotero
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这是一个用于与Zotero Web API v3交互的Python封装客户端。它允许用户程序化地管理学术文献资料，实现文献记录、集合、标签和附件的增删改查。非常适用于构建自动化研究工作流、批量导出引文或将Zotero数据集成到其他研究应用中。
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Apify 演员开发与部署指南

apify-actor-development
sickn33/antigravity-awesome-skills
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本指南详细介绍了Apify Actors的开发和部署流程。学习如何创建、修改和部署无服务器应用（Actors），用于执行网络爬取、数据处理和自动化任务。内容涵盖了CLI环境配置、开发工作流全流程以及数据安全和代码最佳实践。
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数据库模式与架构设计器

database-schema-designer
alirezarezvani/claude-skills
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本工具可将自然语言需求转化为结构化、规范化的关系型数据库模式。它不仅能设计出包含多租户、软删除和审计追踪等高级特性的完整架构，还能自动化生成数据库迁移脚本（支持Prisma、TypeORM等），并同步生成TypeScript/Python类型定义、种子数据和Mermaid格式的ERD，实现从概念到代码的全流程支持。
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