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分子动力学模拟与分析

molecular-dynamics
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
156
使用 OpenMM 和 MDAnalysis 运行并分析分子动力学模拟，包括蛋白质/小分子体系搭建、力场选择、能量最小化、NVT 平衡、生产模拟以及 RMSD、RMSF、接触图和自由能面等轨迹分析，适用于结构生物学、药物结合和生物物理研究。
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NetworkX 图与网络分析

networkx
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
94
使用 Python 的 NetworkX 3.x 创建、分析和可视化复杂网络。支持从数据构建图结构、运行最短路径、PageRank、中心性等算法、社区发现、生成随机与无标度网络，并读写 GraphML、JSON、边列表等多种格式。
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PathML 计算病理学工作流

pathml
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
359
使用 PathML 在本地开展计算病理学研究：加载与切分全切片图像、构建预处理与质控流水线、管理 h5path 数据、量化多重免疫荧光图像、构建空间图并规划有界的模型推理。
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PrimeKG 知识图谱查询

primekg
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75
查询 PrimeKG 精准医学知识图谱，检索基因、药物、疾病和表型节点，获取邻居关联，分析疾病上下文，并探索药物重定位路径。
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Pymatgen 材料分析

pymatgen
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
73
使用 pymatgen 分析、验证、转换材料结构与计算数据，涵盖对称性、相图和 Materials Project 查询，强调数据溯源。
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Scanpy 单细胞分析工具

scanpy
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
257
Scanpy 是一个可扩展的 Python 工具包，用于单细胞 RNA 测序数据分析。涵盖质量控制、标准化、降维、聚类和可视化。支持将 R 格式转换为 h5ad，并提供现成的 CLI 脚本实现端到端工作流，适用于探索性分析和高质量绘图。
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科学可视化

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286
使用 Matplotlib、Seaborn 或 Plotly 创建真实、可访问、可发表的科研图表。确保数据完整性、正确编码、可访问性合规和期刊导出规划。包括不确定性显示、颜色对比审查和元数据验证指南。
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Seaborn 统计可视化库

seaborn
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358
Seaborn 是一个基于 Matplotlib 的 Python 统计可视化库，与 Pandas 深度集成。它提供面向数据集的绘图功能，支持创建出版级质量的统计图形，如箱线图、小提琴图和热力图。适用于探索性数据分析、多变量分析及复杂多面板图表，具有美观的默认样式和统计感知能力。
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ClickHouse数据分析与查询

clickhouse-core-workflow-b
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65
本技能提供了一套完整的ClickHouse数据处理工作流。它涵盖了高效的批量数据插入、高级分析查询（如漏斗分析、留存分析），以及使用物化视图进行数据预聚合。用户可利用此技能构建高性能的OLAP仪表板和执行大规模数据转换。
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专业财务报告生成器

alphaear-reporter
RKiding/Awesome-finance-skills
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本技能提供了一个完整的专业财务报告自动化生成工作流。它指导用户完成报告的规划、撰写和编辑等步骤，并支持生成所需的图表配置。适用于将复杂的财务分析浓缩成结构清晰、可操作的专业报告。
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Clari收入情报数据架构

clari-reference-architecture
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
94
本参考架构提供了构建鲁棒的Clari收入情报数据平台的完整蓝图。它涵盖了整个数据生命周期，包括API数据抽取（ETL流程）、数据仓库建模、变化检测逻辑以及高级分析和告警层。适用于需要构建系统化、可监控的营收预测、跨平台数据集成或企业级收入分析系统的场景。
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ClickHouse性能调优指南

clickhouse-performance-tuning
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本指南提供了一套完整的ClickHouse高性能优化方案。内容涵盖慢查询诊断、优化ORDER BY键、创建数据跳过索引（Bloom/Set/MinMax）、使用投影（Projections）和物化视图，以及调整服务器参数。帮助用户解决大数据OLAP查询缓慢问题，显著提升数据分析和实时报告的效率。
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