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分子特征化库用于机器学习

molfeat
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
302
Molfeat是一个全面的Python库，用于将化学结构（如SMILES字符串）转换为数值特征向量。它集成了超过100种预训练和手工设计的分子特征提取器（如ECFP, MACCS, ChemBERTa）。本工具是构建QSAR模型、进行虚拟筛选、相似性搜索以及在分子数据集上训练深度学习模型的关键辅助工具。
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OMERO显微镜图像数据分析平台

omero-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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本技能为OMERO（开源显微镜数据管理平台）提供了全面的Python集成，用于管理、可视化和分析复杂的显微图像数据。支持通过代码访问图像、检索数据集、管理感兴趣区域（ROIs）和注释，执行深层像素分析，并为高通量筛选和生物成像工作流进行批处理。
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PyTDC：药物发现机器学习数据集

pytdc
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
114
PyTDC是一个开放科学平台，专门为药物发现和治疗领域提供标准化、可直接用于AI训练的权威数据集和基准。它支持单实例预测（如ADME、毒性）、多实例预测（药物-靶点相互作用DTI）以及分子生成等多种核心任务，是药物机器学习模型开发和性能评估的必备工具。
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单细胞组学深度生成模型

scvi-tools
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
390
scvi-tools是一个全面的Python框架，利用深度生成模型和变分推断技术，用于分析单细胞数据的多模态组学数据。它特别适用于进行概率性的批次效应校正、多组学数据整合以及带有不确定性的差异表达分析，支持RNA-seq、ATAC-seq和多组学数据。
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内存外海量数据分析

vaex
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Vaex是一个高性能的Python库，专为内存外（out-of-core）计算设计，能够处理和可视化超出系统内存限制的超大型表格数据集。它支持高效进行大规模数据筛选、统计聚合、可视化和构建机器学习模型，特别适用于单机环境下的TB级数据分析。
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通用科学数据库查询

database-lookup
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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该技能提供对78个公共科学数据库的REST API访问，覆盖生物医学、材料科学、物理学、环境科学和经济学等多个领域。用户可以根据查询目标（如化合物、基因、专利、经济指标等）选择数据库并执行API调用，适用于全面的科学研究和数据收集。
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标注数据管理工具

annotation-data
SharpAI/DeepCamera
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本工具用于管理和处理标注数据集，提供完整的CRUD（创建、读取、更新、删除）功能，支持标签管理和数据导出。核心功能包括支持COCO格式导出和Kaggle平台上传，旨在简化AI模型开发的数据处理流程，提升效率。
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Apify核心存储与工作流管理

apify-core-workflow-b
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
433
本工具提供对Apify核心存储（数据集、键值存储和请求队列）的全面编程管理能力。它可以执行CRUD操作，实现数据持久化和复杂、多阶段的数据管道编排（例如：爬取→转换→导出）。适用于构建健壮的端到端网络爬取和数据处理自动化工作流。
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ClickHouse并发与资源限流配置

clickhouse-rate-limits
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本技能指导如何配置和管理ClickHouse的服务器端资源限制、用户配额和连接管理。当遇到“并发查询过多”或其他资源瓶颈时使用。内容涵盖SQL配额设置、客户端连接池和应用层级的并发控制及重试机制，确保数据操作的稳定性和可靠性。
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Bright Data爬虫成本优化与管理

brightdata-cost-tuning
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本技能旨在帮助用户优化 Bright Data 的爬取服务成本。提供了详细的成本估算模型、缓存策略和使用量监控代码，指导用户在进行大规模网络数据采集时，选择最合适的产品和最佳的预算管理方案。
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ClickHouse快速上手与数据分析

clickhouse-hello-world
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
343
本指南是一个ClickHouse数据库的完整入门教程。内容涵盖了使用MergeTree创建表结构、通过代码（TypeScript）插入结构化事件数据，以及执行核心分析查询（如计数、分组、唯一用户统计）的完整流程。适用于初学者学习OLAP数据库、测试数据库连接或掌握数据仓库最佳实践。
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ClickHouse客户端配置与认证

clickhouse-install-auth
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本技能详细指导如何配置和认证官方ClickHouse客户端（支持Node.js和Python）。覆盖了连接ClickHouse Cloud或自建服务器的全部流程，包括环境配置、关键环境参数设置和代码实现，适用于进行数据分析项目或构建数据管道。
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