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get-available-resources
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
355
该技能检测主机资源库存,包括 CPU、内存、磁盘、调度器、容器和加速器限制,用于资源感知规划。生成脱敏 JSON 快照,无压力测试且不假设硬件可用性。支持 Python 3.11+ 及 Linux、macOS、Windows 系统。
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生物信息学数据库查询工具
gget
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
362
gget 是一个命令行和 Python 包,提供对 20 多个基因组数据库和分析方法的统一访问。支持查询基因信息、序列分析、蛋白质结构、病毒序列、表达数据和疾病关联。适用于交互式探索和简单查询,提供命令行和 Python 函数接口,方便生物信息学工作流。
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Gtars 基因组区间工具包
gtars
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
259
Gtars 用于本地基因组区间建模、集合运算、重叠计数、共识覆盖、标记化、片段处理以及 refget/BEDbase 规划,支持 Python、Rust 和 CLI。
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Histolab 全切片图像分块提取
histolab
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
314
面向数字病理全切片图像(WSI)的 Python 库,支持组织检测、切片分块提取、图像滤波与染色归一化,适合为深度学习准备 H&E 数据集及快速的分块分析。
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LabArchives API 集成
labarchive-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
360
安全对接 LabArchives 官方 ELN API 与 Inventory API v1:选择区域端点、构造 HMAC-SHA-512 签名请求、处理用户授权与 UID 流程,并用本地 Python 工具校验凭证与环境配置。
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Latch 生信工作流集成
latchbio-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
252
在 Latch 平台上使用 Python SDK、CLI、Nextflow、Snakemake、Latch Data、Registry 和 MCP 构建、注册、调试与运行生物信息学工作流,涵盖资源配置、数据管理、界面表单和任务监控。
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证据导向市场调研工具
market-research-reports
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
274
该技能用于生成可审计的市场研究报告和市场规模测算场景。确保每个主张都能追溯到原始来源,区分事实与估算。适用于市场定义、竞争格局分析及带有敏感性分析的预测模型构建。支持 Python 工作流和 LaTeX 模板。
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Matchms 质谱数据处理
matchms
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
497
基于 Python 的串联质谱数据处理技能,使用 matchms 0.33.1 完成 MS/MS 文件读写、元数据标准化、峰过滤、谱图相似度打分、谱库检索匹配、得分矩阵与分子相似性网络构建,适用于代谢组学谱图分析。
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MATLAB 与 GNU Octave 工作流
matlab
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
209
用于设计、审查、迁移并安全规划 MATLAB 或 GNU Octave 数值工作流,涵盖数组、表格与时间数据、函数、测试、工程、绘图、MAT 文件及 Python 互操作,并强调产品许可与执行安全边界。
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Matplotlib 数据可视化库
matplotlib
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
330
Matplotlib 是 Python 基础可视化库,用于创建静态、动画和交互式图表。支持线、散点、柱状图等多种类型,适用于科学统计可视化。可自定义外观、创建多面板图表,并导出为 PNG、PDF 等格式。适合制作出版级图形及集成到 Jupyter 笔记本中。
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Medchem 化合物筛选
medchem
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
62
基于 Python 的药物化学分子筛选工具,用于化合物库的分类与优先级排序。支持类药性规则(Lipinski、Veber、CNS)、结构警示目录(PAINS、NIBR、ChEMBL)、复杂度指标、官能团检测及查询语言,适用于大规模分子筛选与命中到先导化合物优化。
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Modal 无服务器 Python 平台
modal
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
495
Modal 是一个无服务器云平台,用于按需运行 Python 代码,包括 GPU 加速的 AI/ML 工作负载。适用于部署模型、提供 Web API、批处理任务和将 Python 应用程序扩展到云容器,支持从零到数千个实例的自动扩展。支持自定义容器镜像、持久化存储和亚秒级冷启动以实现低延迟推理。
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