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搜索 Python ，共找到 824 条记录
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单细胞数据分析矩阵库

anndata
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489
Anndata 是一个用于处理标注数据矩阵的 Python 包，支持存储实验测量值及观测变量元数据。它适用于单细胞基因组分析，高效管理 h5ad 和 Zarr 文件。用户可读取、写入、合并及子集化数据，支持稀疏矩阵。可与 Scanpy 等 scverse 生态系统工具集成，适合需要高效存储和操作的生物数据分析工作流。
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Astropy 天文学数据分析核心库

astropy
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230
Astropy 是天文学核心 Python 库，提供天文学研究及数据分析所需功能。支持坐标转换、单位计算、FITS 文件操作、宇宙学计算、时间处理、表格操作及图像分析。适用于天文数据分析代码实现与调试。
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Benchling 实验室数据集成

benchling-integration
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278
使用 Benchling Python SDK 与 v2 REST API 集成注册实体、库存、ELN 记录、工作流及数据仓库，实现实验室数据自动化导入、FASTA 序列创建、库存审计与事件驱动应用，支持 API Key 或 OAuth 认证。
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Biopython 生物信息学工作流

biopython
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提供 Biopython 工作流，用于序列操作、FASTA/GenBank/PDB 文件解析、系统发育分析、BLAST 自动化、结构分析，以及通过 Bio.Entrez 访问 NCBI/PubMed。
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生物信息服务Python接口

bioservices
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385
通过 Python 访问 UniProt、KEGG、ChEMBL、Reactome、QuickGO、UniChem 等生物信息服务的客户端，支持跨库蛋白质注释、通路检索、化合物标识映射与整合分析。
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Cirq 量子计算框架

cirq
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Cirq 是 Google 开源的量子计算框架，用于设计、模拟和运行量子电路。支持 NISQ 电路、噪声建模及与 Google 量子 AI 等硬件集成。适用于基于 Python 的量子电路开发与优化。
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Dask 并行分布式计算库

dask
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299
Dask 是一个用于并行和分布式计算的 Python 库，能够扩展 pandas 和 NumPy 工作流以处理超出内存限制的数据。它支持 DataFrame、数组和 Bag 组件，适用于单机或集群上的大规模数据处理、科学计算及并行任务调度，特别适合内存不足或需要分布式执行场景。
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Datamol 化学信息学工具包

datamol
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128
基于 RDKit 的 Python 化学信息学封装库，提供分子格式转换、结构标准化、描述符与指纹计算、聚类与多样性筛选、3D 构象生成等药物发现工作流，支持并行批处理，返回原生 RDKit Mol 对象。
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NGS数据分析工具包

deeptools
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157
用于高通量测序数据分析的Python命令行工具包，支持ChIP-seq、RNA-seq和ATAC-seq等实验。提供质量控制、数据标准化、样本比较和高质量基因组可视化功能，包括bigWig转换和热图分析。
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ESM 蛋白质生成 SDK

esm
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67
Biohub ESM SDK 用于蛋白质生成、ESMC 嵌入和 ESMFold2 全原子折叠。支持本地模型推理和托管客户端，用于蛋白质序列补全、结构预测和嵌入提取。需要 Python 3.12+ 和隔离环境配置。
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地理空间分析工作流

geomaster
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413
提供遥感、矢量与栅格 GIS、空间统计、地形与网络分析以及地球观测机器学习的空间研究工作流，支持 Python、R、Julia 等多种语言。
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GeoPandas 矢量数据审计

geopandas
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239
面向 Python 的 GeoPandas 工作流指南与本地审计工具，覆盖 GeoSeries、GeoDataFrame、空间运算、CRS 处理与矢量数据读写，并提供来源校验、几何有效性、隐私脱敏等安全门禁。
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