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临床实体到FHIR资源提取

extract-clinical-entities-to-fhir
maziyarpanahi/openmed
297
该工具用于从合成或脱敏的临床文本中提取实体。它通过OpenMed识别关键的临床信息跨度，并将这些信息映射为符合FHIR R4标准的结构化资源（如Condition、Observation等）。这实现了实体提取与临床编码的分离，确保输出数据具备标准化和可互操作性。
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提取临床生物医学实体

extracting-clinical-entities
maziyarpanahi/openmed
320
用于从临床医学文本中执行实体的命名实体识别 (NER)。它可以提取疾病、药物、解剖结构、基因和蛋白质等结构化生物医学实体，并提供实体的精确字符范围和模型置信度得分。是构建专业、隐私优先的临床自然语言处理 (NLP) 流程的关键工具。
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提取DICOM元数据和报告文本

extracting-dicom-metadata
maziyarpanahi/openmed
136
本技能用于从DICOM影像文件中提取关键的患者元数据（如姓名、日期）和结构化报告文本。它解决了将医疗影像导入自然语言处理（NLP）流程的痛点，是进行数据脱敏和临床文本分析的必要前置步骤。
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文档结构化检验报告提取

extracting-lab-tables
maziyarpanahi/openmed
284
本技能能够自动检测并从扫描图像、照片、CSV/TSV等多种来源提取结构化的实验室表格面板。它将复杂的视觉报告数据转化为干净的结构化行记录，包含检验项名称、数值、单位、参考范围和异常标记。该功能是准备医疗数据进行LOINC/UCUM编码和映射至FHIR资源的关键前置步骤。
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从临床文本提取个人身份信息

extracting-pii-entities
maziyarpanahi/openmed
102
使用 openmed.extract_pii 检测临床文本中的个人身份信息（PII）或受保护健康信息（PHI）范围（如姓名、日期、病历号等）。与脱敏功能不同，它返回原始文本和检测到的跨度，用户无需修改源数据即可进行审计、预览脱敏效果、规范化标签或路由到自定义匿名化处理程序。非常适用于数据预处理和策略执行。
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提取社会决定因素与代码映射

extracting-sdoh
maziyarpanahi/openmed
305
本功能用于从非结构化的临床叙述中提取社会决定因素（SDOH），包括住房不稳定、食物不安全和交通障碍等。它将这些文本片段映射到标准化的ICD-10-CM Z代码（Z55–Z65）。这对于进行健康公平性分析、构建风险分层模型和识别编码缺失至关重要，能将叙述性文本转化为可查询的离散数据点。
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提取和处理FHIR R4临床记录

fetching-fhir-resources
maziyarpanahi/openmed
371
该技能用于从FHIR R4电子病历API（如Epic, Cerner）中提取和处理未结构化的临床病历和报告。它负责处理分页查询、解码Base64附件（PDF, TXT）以及提取叙事文本。随后，文本会被传递给OpenMed流程进行符合HIPAA标准的去标识化和自然语言处理分析，从而将原始临床记录转化为可分析的结构化洞察。
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高级文件系统管理工具

filesystem
opensquilla/opensquilla
235
这是一个为AI智能体设计的综合性文件系统管理技能。它提供高级功能，包括支持深度过滤的智能文件列表、强大的内容和模式搜索、安全的批量文件复制，以及详细的目录分析（如统计和树状结构）。非常适用于代码分析、系统审计和项目资源管理。
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去标识化泄漏检测门禁

gating-deid-leakage
maziyarpanahi/openmed
279
该技能用于在持续集成 (CI) 环境中为去标识化模型创建强制门禁。它能自动检测模型是否发生了性能退化（召回率下降）或是否泄露了关键的个人身份信息（PHI）。通过失败构建，确保只有满足严格隐私和性能标准的模型才能通过合并，从而防止数据泄露。
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生成代码测试用例

generate-tests
FlorianBruniaux/claude-code-ultimate-guide
127
该工具可分析指定的源代码文件或模块，自动生成全面且结构化的测试用例。它能识别函数、类和方法等可测试单元，并遵循项目最佳实践（如 AAA 模式），确保覆盖正常流程、边界条件、空值和各种错误处理场景，兼容 Jest、Vitest 和 pytest 等主流测试框架。
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合成临床数据生成工具

generating-synthea-data
maziyarpanahi/openmed
163
Synthea用于生成统计学上高度逼真、完全合成的患者记录，支持FHIR R4、C-CDA和CSV等多种格式。本工具为开发人员和研究人员提供安全、可共享的测试数据，可用于OpenMed流程测试、持续集成（CI）模拟或脱敏泄漏门测试集，确保零真实PHI风险。
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合成替代数据去标识化

generating-synthetic-surrogates
maziyarpanahi/openmed
121
本技能用于将临床文本中的受保护健康信息（PHI）替换为逼真的、类型匹配的合成替代数据。与简单遮蔽不同，替代数据保持了文本的自然可读性和结构，确保数据在后续的NLP处理、质量保证或人工审阅时仍然可解析。它支持一致性和自定义生成器，适用于需要可读的去标识化场景。
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