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生物信息学:多数据库统一接口
bioservices
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
285
这是一个全面的Python库,提供了对40多个生物信息学数据库(如UniProt, KEGG, ChEMBL等)的编程访问接口。适用于复杂的生物学工作流,包括跨数据库ID映射、代谢通路分析、蛋白质序列检索和序列相似性搜索等,实现数据整合和自动化分析。
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AI智能体自进化引擎
capability-evolver
EvoMap/evolver
120
Evolver是一款为AI智能体设计的自进化引擎。它能深入分析运行时的历史记录,识别性能缺陷和效率低点,并自主编写和应用改进方案。其架构通过本地代理信箱(Proxy Mailbox)与EvoMap Hub进行安全通信,适用于构建高度自适应、持续迭代的智能系统。
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大规模单细胞转录组数据查询
cellxgene-census
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
179
该技能提供对CZ CELLxGENE大型、版本化单细胞和空间转录组数据的程序化访问。用户无需下载整个数据集,即可查询数百万个细胞的基因表达数据,分析不同组织、疾病和物种间的差异。适用于大规模生物信息学分析、机器学习模型训练和跨数据集比较研究。
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量子电路模拟与编程框架
cirq
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
476
Cirq是Google Quantum AI开发的开源Python框架,用于设计、模拟和运行量子电路。它支持多种硬件后端,并提供了完整的噪声模型、电路优化和参数化实验功能,是进行NISQ设备开发和高级量子计算研究的理想工具。
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学术引用文献管理
citation-management
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
458
本技能提供完整的学术引用管理流程,指导用户在研究和写作过程中系统性地处理引文。功能包括搜索Google Scholar和PubMed等学术数据库,从DOI、PMID等多种标识符中提取元数据,验证引文准确性,并生成符合规范的BibTeX格式文件,适用于撰写高质量的学术论文和学位论文。
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临床决策支持研究评估工具
clinical-decision-support
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
493
本工具包专用于生成和验证临床决策支持(CDS)系统的研究级文档和评估工件。支持证据档案、队列分析、生存模型、生物标志物评估和治理流程的构建。请注意:本工具仅用于汇总研究和文档记录,绝对不能用于患者护理、诊断或实时临床操作。
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临床安全报告草稿生成
clinical-reports
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
373
本技能用于生成各类临床、安全和汇总研究报告(如CSR、汇总安全表)的草稿结构和确定性检查。它要求使用经过验证、去识别化或合成的源数据,并确保所有生成的主张都可追溯到来源事实清单。重要提示:本技能仅生成草稿和进行内部一致性检查,不能进行诊断、推荐治疗或提供医疗建议。所有输出均非临床用途,必须经过合格人员审核和签署。
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约束代谢模型分析
cobrapy
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
384
COBRApy是一个强大的Python库,用于进行基于约束的代谢模型分析。它支持加载、操作和优化生物体代谢模型(如SBML格式)。核心功能包括通量平衡分析(FBA)、通量变异分析(FVA)和基因/反应敲除模拟,是系统生物学和代谢工程领域不可或缺的分析工具。
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心智议会
consciousness-council
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
86
通过模拟不同思维原型,从多角度讨论难题、权衡利弊、识别风险,并输出可执行的综合结论,适合复杂决策、创意发想和策略分析。
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上下文模式工程洞察面板
ctx-insight
mksglu/context-mode
136
本工具可打开上下文模式的洞察仪表盘,为AI辅助工程团队提供中央分析层。用户可以查看每位工程师的生产力速率、识别重复尝试浪费、检测项目阻碍点,并获取按角色划分的详细性能视图。它是团队性能监控和登录信息的单一信息源。
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分布式大数据计算框架
dask
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
206
Dask是一个强大的Python库,用于处理超出内存限制或需要跨多机并行计算的大型数据集。它可以扩展传统的pandas和NumPy操作(DataFrame/Array),并处理非结构化数据(Bags)。适用于大规模数据抽取、转换、加载(ETL)、数据分析和分布式机器学习任务。
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Datamol:分子化学信息学工具库
datamol
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
91
Datamol是一个基于RDKit的高级Python封装层,专为计算化学和药物发现设计。它简化了复杂的分子操作,提供智能默认值来处理SMILES标准化、描述符计算、指纹图生成、三维构象分析和分子聚类等任务。该库支持高效的并行计算和云存储I/O,非常适合处理大规模的化学数据集。
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