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生物信息学数据分析

bioservices
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
437
这是一个功能全面的Python库，为超过40个主要的生物信息学网络服务和数据库提供了统一的编程接口。它专为复杂的生物学工作流设计，支持跨数据库查询（如UniProt、KEGG、ChEMBL）、ID映射、蛋白质序列检索、通路分析以及运行BLAST等序列相似性搜索，极大地简化了来自多个生命科学资源的数据集成过程。
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AI智能体自进化引擎

capability-evolver
EvoMap/evolver
120
Evolver是一款为AI智能体设计的自进化引擎。它能深入分析运行时的历史记录，识别性能缺陷和效率低点，并自主编写和应用改进方案。其架构通过本地代理信箱（Proxy Mailbox）与EvoMap Hub进行安全通信，适用于构建高度自适应、持续迭代的智能系统。
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细胞图谱数据查询与分析

cellxgene-census
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
225
该技能提供对CZ CELLxGENE大型公共单细胞和空间转录组学数据的程序化访问。用户无需下载整个数据集，即可按细胞类型、组织、疾病等维度进行高效查询，获取基因表达矩阵、元数据和预计算的嵌入信息。适用于大规模、跨数据集的生物学研究和模型训练。
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量子计算电路框架

cirq
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
440
Cirq是Google Quantum AI开源的量子计算框架，用于设计、仿真、优化和运行量子电路。它支持NISQ电路开发、噪声建模以及针对Google、IonQ等多种量子硬件后端进行编译。该框架是进行量子算法研究和硬件测试的专业工具。
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学术文献引用与管理

citation-management
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
103
该技能提供全面的学术引用管理解决方案，用于科学研究和撰写学术论文。用户可以通过它在Google Scholar和PubMed等数据库搜索文献，提取准确的元数据，验证引文信息，并生成标准的BibTeX格式。同时支持生成科学示意图，提高文档的可视化和专业性。
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临床决策支持报告生成

clinical-decision-support
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
102
为制药和临床研究领域生成专业的临床决策支持（CDS）文档。该技能专注于基于证据的分析，包括生物标志物分层患者队列分析、带GRADE分级的治疗推荐报告。支持高级统计分析和专业格式输出，适用于监管申报和医学指南的撰写。
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临床报告撰写与规范化

clinical-reports
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
320
本技能旨在提供专业、全面的医疗报告撰写支持，覆盖病例报告、诊断报告、临床试验报告和病历记录等。它严格要求遵循HIPAA、FDA和ICH-GCP等监管标准，并强制利用AI生成科学图表，确保文档具备高度的准确性、完整性和可发布性。
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代谢模型与系统生物学分析

cobrapy
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
137
COBRApy是一个强大的Python库，用于约束性重构与分析（COBRA）。它支持进行代谢模型的构建、模拟和分析，特别适用于系统生物学研究。核心功能包括通量平衡分析（FBA）、通量变异分析（FVA）、基因或反应缺失突变体模拟，以及优化生长培养基。支持SBML、JSON、YAML等多格式代谢模型。
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意识议会：多维视角决策系统

consciousness-council
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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这是一个结构化的思维模拟系统，能够从多个认知角度（如伦理学家、未来学家、反对者）审视任何问题。它不会给出单一答案，而是通过让不同视角激烈碰撞，帮助用户发掘隐藏的盲点、核心矛盾，最终得出全面且可执行的决策洞察。
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上下文模式工程洞察面板

ctx-insight
mksglu/context-mode
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本工具可打开上下文模式的洞察仪表盘，为AI辅助工程团队提供中央分析层。用户可以查看每位工程师的生产力速率、识别重复尝试浪费、检测项目阻碍点，并获取按角色划分的详细性能视图。它是团队性能监控和登录信息的单一信息源。
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Dask：分布式并行计算框架

dask
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Dask是一个强大的Python库，用于实现并行和分布式计算。它允许用户将现有的Pandas和NumPy工作流扩展到超出可用内存的规模，从而高效处理高达TB级别的超大数据集。它提供了专门的API（DataFrame、Array、Bag），用于处理结构化、科学和非结构化数据，支持单机或集群部署。
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Python分子化学信息学工具包

datamol
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Datamol是一个基于RDKit的Python化学信息学工具库，它提供了一个简化的、Python化的抽象层，使复杂的分子操作变得易于使用。它支持SMILES解析、结构标准化、分子描述符计算、3D构象生成和高效批处理，非常适合在药物发现和化学研究流程中处理分子数据。
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