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AI图像生成与编辑工具
generate-image
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
125
该技能通过OpenRouter API调用多种先进AI模型(如Gemini, FLUX, GPT-Image等),实现高质量的图像生成与编辑。适用于创作照片级艺术作品、概念图、Logo设计、插画或执行复杂的图像合成与修饰,并支持分辨率、随机种子等多种参数控制。
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基因组区间机器学习工作流
geniml
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
412
Geniml是一个用于基因组区间数据机器学习和统计工作流的框架。它将坐标、组装序列和模型工件视为明确的“合约”,用于验证数据结构(如BED文件),并规划复杂的本地化运行(如Region2Vec或scEmbed)。该工具注重结果的可复现性、符合生物数据标准,并强调本地处理,避免不必要的网络调用。
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综合地理空间分析工具
geomaster
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
57
这是一个全面的地理空间科学技能包,涵盖了遥感、GIS、空间统计和地球观测机器学习。它支持处理栅格、矢量、点云等多种数据类型(如Sentinel、Landsat),并集成了现代云原生工作流(STAC、COG)。适用于环境监测、城市规划和复杂的空间分析任务。
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GeoPandas地理空间矢量数据处理
geopandas
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
380
本指南是使用GeoPandas进行高级地理空间矢量数据处理的专业手册。它侧重于平面矢量数据的工作流,强调数据溯源、坐标参考系统(CRS)管理和复杂空间操作。详细阐述了处理敏感地理信息时必须遵循的安全和正确性规范,确保开发流程的科学性和可复现性。
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检测可用系统资源用于工作负载规划
get-available-resources
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
358
该工具提供了一个保守、资源感知的当前进程环境快照,涵盖CPU、内存、磁盘和加速器等资源限制。它通过提供明确的边界约束(如cgroup、调度器和宿主机限制),帮助用户进行准确的工作负载规划,无需执行压力测试或做出可用性假设。
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生物信息学数据库查询工具
gget
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
206
gget是一个综合性的命令行和Python工具包,提供对20多个生物信息学数据库的统一访问。它支持基因组学、蛋白质组学和疾病关联等多个领域的深度分析。功能包括基因信息查询、序列比对、结构预测(如AlphaFold)和富集分析,适用于生物信息学科研和自动化流程。
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金合云实验室:自动化蛋白质研究平台
ginkgo-cloud-lab
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
321
金合云实验室提供远程访问先进的自主实验室基础设施,用户可以在此提交和管理复杂的分子生物学实验方案。它支持多种应用,包括蛋白质表达和纯化(无细胞、大肠杆菌、毕赤酵母)、定量检测(HiBiT、A280、LabChip)、核酸合成(IVT mRNA/circRNA)以及特性分析(热移谱、Echo-MS、SPR)。该平台还集成了AI智能体,用于评估和定价定制工作流程。
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蛋白质糖基工程分析
glycoengineering
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
269
本技能用于专业分析和设计蛋白质的糖基化修饰。它能够扫描蛋白质序列以识别N-糖基化位点和预测O-糖基化热点,支持用户优化治疗性抗体、提高蛋白质稳定性,或进行疫苗抗原设计,是生物药物研发的关键工具。
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Gtars:基因组区间处理工具包
gtars
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
62
Gtars是一个强大的工具包,提供基于Rust和Python绑定的基因组区间处理能力。它支持集合代数、覆盖度计算、分词和片段处理等核心生物信息学任务。该库强调数据完整性,通过强制执行严格的基因组数据契约,确保在复杂的计算流程中正确处理坐标、组装信息和参考序列。
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数字病理全玻片图像分析
histolab
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
167
Histolab是一个专门用于数字病理学的Python库。它能自动化处理全玻片图像(WSI),实现复杂的组织检测、可定制的切片提取(包括随机、网格、评分机制)和染色标准化。适用于构建高质量、结构化的数据集,用于深度学习模型训练和全面的定量分析。
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LLM辅助假设生成与审计
hypogenic
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
180
该技能用于利用大型语言模型(LLM)和带标签的数据集,迭代地提出和评分文本模式,生成候选假设和任务预测统计。它提供了一套严格的本地审查工作流,强调数据集的哈希审计、配置验证,明确指出其输出仅为候选结果,不能作为科学或临床结论。
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科学假说生成与测试框架
hypothesis-generation
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
276
该框架指导用户将原始观察数据转化为严谨、证据受限且可测试的研究计划。它涵盖了建立研究问题(如PICO)、构建候选假说、提出竞争性解释、定义因果估计量和制定预注册分析方案,旨在帮助用户科学、透明地推进研究,并强调了科学的伦理和方法论边界。
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